RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.99■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 IFT140Q96RY7 1462 aa20.97■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.97■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 PTMSP20962 102 aa20.97■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 MAP7D2Q96T17 732 aa20.97■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.97■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PACS1-201ENST00000320580 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.94■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.94■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.93■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 UACAQ9BZF9 1416 aa20.92■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.949e-8■□□□□ 10.2
PACS1-201ENST00000320580 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 CLCN1P35523 988 aa20.92■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.91■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.91■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.9■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.9■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.9■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
PACS1-201ENST00000320580 USP47Q96K76 1375 aa20.89■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.89■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 MCM4P33991 863 aa20.89■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 COG6Q9Y2V7 657 aa20.88■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 TSPY4P0CV99 314 aa20.88■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 TSPY10P0CW01 314 aa20.88■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.88■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 PANK2Q9BZ23 570 aa20.87■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 MAPKBP1O60336 1514 aa20.87■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 PKD2Q13563 968 aa20.86■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.84■□□□□ 0.93
PACS1-201ENST00000320580 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.82■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 TMF1P82094 1093 aa20.81■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.8■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.8■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.8■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.79■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.78■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.77■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 UQCRHP07919 91 aa20.77■□□□□ 0.92
PACS1-201ENST00000320580 SLC24A1O60721 1099 aa20.76■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.76■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 PTPRGP23470 1445 aa20.76■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.75■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 PDE4CQ08493 712 aa20.74■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 CDCA8Q53HL2 280 aa20.73■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.73■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 PANK3Q9H999 370 aa20.72■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.72■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 PANK1Q8TE04 598 aa20.71■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.71■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 OSCARQ8IYS5 282 aa20.71■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PACS1-201ENST00000320580 APAF1O14727 1248 aa20.69■□□□□ 0.9
PACS1-201ENST00000320580 CASC1Q6TDU7 716 aa20.69■□□□□ 0.9
PACS1-201ENST00000320580 PRDM2Q13029 1718 aa20.67■□□□□ 0.9
PACS1-201ENST00000320580 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.67■□□□□ 0.9
PACS1-201ENST00000320580 C8orf34Q49A92 452 aa20.67■□□□□ 0.9
PACS1-201ENST00000320580 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.67■□□□□ 0.9
PACS1-201ENST00000320580 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.65■□□□□ 0.9
PACS1-201ENST00000320580 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PACS1-201ENST00000320580 CFAP53Q96M91 514 aa20.65■□□□□ 0.9
PACS1-201ENST00000320580 CUL7Q14999 1698 aa20.65■□□□□ 0.9
PACS1-201ENST00000320580 E9PSI1 815 aa20.64■□□□□ 0.9
PACS1-201ENST00000320580 MCTP1Q6DN14 999 aa20.64■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 DRC7Q8IY82 874 aa20.64■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 NCOA1Q15788 1441 aa20.64■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 BCAR3O75815 825 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 RNF214Q8ND24 703 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 GRIN2AQ12879 1464 aa20.63■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.896e-7■■■■□ 23.7
PACS1-201ENST00000320580 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.62■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.6■□□□□ 0.89
PACS1-201ENST00000320580 SYNJ2O15056 1496 aa20.6■□□□□ 0.89
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