RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.17■■■□□ 2.74
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.16■■■□□ 2.74
VSTM4-201ENST00000298454 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.73
VSTM4-201ENST00000298454 DEPDC5O75140 1603 aa32.13■■■□□ 2.73
VSTM4-201ENST00000298454 KIF3BO15066 747 aa32.12■■■□□ 2.73
VSTM4-201ENST00000298454 NEO1Q92859 1461 aa32.12■■■□□ 2.73
VSTM4-201ENST00000298454 KDM5CP41229 1560 aa32.12■■■□□ 2.73
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.1■■■□□ 2.73
VSTM4-201ENST00000298454 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.07■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF11Q8TEB1 546 aa32.07■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 ATP10AO60312 1499 aa32.07■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.06■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32.06■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 GLI2P10070 1586 aa32.06■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 RAPGEF3O95398 923 aa32.04■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 E9PCH4 1651 aa32.03■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 A2MP01023 1474 aa32.03■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 KANK1Q14678 1352 aa32.03■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.02■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.02■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.02■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.01■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.01■■■□□ 2.72
VSTM4-201ENST00000298454 RGL3Q3MIN7 710 aa32.01■■■□□ 2.71
VSTM4-201ENST00000298454 FAM69CQ0P6D2 419 aa32■■■□□ 2.71
VSTM4-201ENST00000298454 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
VSTM4-201ENST00000298454 TET3O43151 1660 aa31.97■■■□□ 2.71
VSTM4-201ENST00000298454 DIP2BQ9P265 1576 aa31.97■■■□□ 2.71
VSTM4-201ENST00000298454 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.96■■■□□ 2.71
VSTM4-201ENST00000298454 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.96■■■□□ 2.71
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
VSTM4-201ENST00000298454 ABCA6Q8N139 1617 aa31.94■■■□□ 2.7
VSTM4-201ENST00000298454 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
VSTM4-201ENST00000298454 USP47Q96K76 1375 aa31.91■■■□□ 2.7
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRTO14522 1441 aa31.91■■■□□ 2.7
VSTM4-201ENST00000298454 TRPM2O94759 1503 aa31.91■■■□□ 2.7
VSTM4-201ENST00000298454 RICTORQ6R327 1708 aa31.89■■■□□ 2.7
VSTM4-201ENST00000298454 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.88■■■□□ 2.69
VSTM4-201ENST00000298454 PRAG1Q86YV5 1406 aa31.88■■■□□ 2.69
VSTM4-201ENST00000298454 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
VSTM4-201ENST00000298454 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.87■■■□□ 2.69
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC7Q96M83 1385 aa31.87■■■□□ 2.69
VSTM4-201ENST00000298454 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.83■■■□□ 2.69
VSTM4-201ENST00000298454 ANP32CO43423 234 aa31.83■■■□□ 2.69
VSTM4-201ENST00000298454 GGT6Q6P531 493 aa31.83■■■□□ 2.69
VSTM4-201ENST00000298454 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.82■■■□□ 2.68
VSTM4-201ENST00000298454 CLTCL1P53675 1640 aa31.82■■■□□ 2.68
VSTM4-201ENST00000298454 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.81■■■□□ 2.68
VSTM4-201ENST00000298454 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
VSTM4-201ENST00000298454 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.8■■■□□ 2.68
VSTM4-201ENST00000298454 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
VSTM4-201ENST00000298454 TSPOAP1O95153 1857 aa31.79■■■□□ 2.68
VSTM4-201ENST00000298454 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa31.79■■■□□ 2.68
VSTM4-201ENST00000298454 CEP152O94986 1710 aa31.79■■■□□ 2.68
VSTM4-201ENST00000298454 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.79■■■□□ 2.68
VSTM4-201ENST00000298454 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.78■■■□□ 2.68
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF1Q3BBV0 1214 aa31.74■■■□□ 2.67
VSTM4-201ENST00000298454 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
VSTM4-201ENST00000298454 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.74■■■□□ 2.67
VSTM4-201ENST00000298454 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.72■■■□□ 2.67
VSTM4-201ENST00000298454 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.7■■■□□ 2.66
VSTM4-201ENST00000298454 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.7■■■□□ 2.66
VSTM4-201ENST00000298454 ABCC3O15438 1527 aa31.68■■■□□ 2.66
VSTM4-201ENST00000298454 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.68■■■□□ 2.66
VSTM4-201ENST00000298454 NPATQ14207 1427 aa31.68■■■□□ 2.66
VSTM4-201ENST00000298454 GPRASP1Q5JY77 1395 aa31.68■■■□□ 2.66
VSTM4-201ENST00000298454 CCER2I3L3R5 266 aa31.66■■■□□ 2.66
VSTM4-201ENST00000298454 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.63■■■□□ 2.65
VSTM4-201ENST00000298454 MADDQ8WXG6 1647 aa31.62■■■□□ 2.65
VSTM4-201ENST00000298454 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.61■■■□□ 2.65
VSTM4-201ENST00000298454 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
VSTM4-201ENST00000298454 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.6■■■□□ 2.65
VSTM4-201ENST00000298454 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
VSTM4-201ENST00000298454 LAMC1P11047 1609 aa31.59■■■□□ 2.65
VSTM4-201ENST00000298454 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.58■■■□□ 2.65
VSTM4-201ENST00000298454 STAC3Q96MF2 364 aa31.57■■■□□ 2.64
VSTM4-201ENST00000298454 KIF1BO60333 1816 aa31.55■■■□□ 2.64
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
VSTM4-201ENST00000298454 MROH2AA6NES4 1674 aa31.53■■■□□ 2.64
VSTM4-201ENST00000298454 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
VSTM4-201ENST00000298454 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.5■■■□□ 2.63
VSTM4-201ENST00000298454 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
VSTM4-201ENST00000298454 NOS1P29475 1434 aa31.49■■■□□ 2.63
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRB3O60242 1522 aa31.49■■■□□ 2.63
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.47■■■□□ 2.63
VSTM4-201ENST00000298454 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
VSTM4-201ENST00000298454 MYOM2P54296 1465 aa31.46■■■□□ 2.63
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa31.45■■■□□ 2.63
VSTM4-201ENST00000298454 TESK2Q96S53 571 aa31.44■■■□□ 2.62
VSTM4-201ENST00000298454 IFT172Q9UG01 1749 aa31.43■■■□□ 2.62
VSTM4-201ENST00000298454 REREQ9P2R6 1566 aa31.43■■■□□ 2.62
VSTM4-201ENST00000298454 SYNMO15061 1565 aa31.42■■■□□ 2.62
VSTM4-201ENST00000298454 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31.4■■■□□ 2.62
VSTM4-201ENST00000298454 AGLP35573 1532 aa31.39■■■□□ 2.62
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.39■■■□□ 2.61
VSTM4-201ENST00000298454 IQGAP1P46940 1657 aa31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms