RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 A0A0G2JS52 829 aa20.86■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 STK26Q9P289 416 aa20.86■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 GRIN2BQ13224 1484 aa20.85■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.85■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 MAPKBP1O60336 1514 aa20.84■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.83■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 AKNAQ7Z591 1439 aa20.83■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.83■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 HSCBQ8IWL3 235 aa20.81■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 PLCB2Q00722 1185 aa20.81■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 APAF1O14727 1248 aa20.81■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 SLC4A3P48751 1232 aa20.81■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.8■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 DAPK1P53355 1430 aa20.79■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.79■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.79■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 FAM161AQ3B820 660 aa20.77■□□□□ 0.92
MEGF6-201ENST00000294599 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.76■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.76■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 HECW1Q76N89 1606 aa20.75■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.75■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 USP35Q9P2H5 1018 aa20.75■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.74■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 E9PSI1 815 aa20.74■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.73■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.73■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.72■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.71■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 COG6Q9Y2V7 657 aa20.71■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 ROCK1Q13464 1354 aa20.71■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
MEGF6-201ENST00000294599 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.7■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 SOX12O15370 315 aa20.7■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 PTPRKQ15262 1439 aa20.7■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.69■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 KCNJ4P48050 445 aa20.68■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.67■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 CUL7Q14999 1698 aa20.67■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 MSH5O43196 834 aa20.66■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 FGD1P98174 961 aa20.66■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.66■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 ABCC5O15440 1437 aa20.65■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 NCOA1Q15788 1441 aa20.65■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 APBB1O00213 710 aa20.65■□□□□ 0.9
MEGF6-201ENST00000294599 MLECQ14165 292 aa20.64■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.62■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.62■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.61■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.61■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 IQGAP2Q13576 1575 aa20.61■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 PPP2R1AP30153 589 aa20.6■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 GSE1Q14687 1217 aa20.6■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.59■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.59■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 IFT140Q96RY7 1462 aa20.59■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 NGEFQ8N5V2 710 aa20.58■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.58■□□□□ 0.89
MEGF6-201ENST00000294599 STAC3Q96MF2 364 aa20.57■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 SYNJ2O15056 1496 aa20.57■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 MCCP23508 829 aa20.57■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 AFAP1Q8N556 730 aa20.57■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 GBP4Q96PP9 640 aa20.57■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.56■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 CFAP44Q96MT7 982 aa20.56■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.54■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 BACH2Q9BYV9 841 aa20.54■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.54■□□□□ 0.88
MEGF6-201ENST00000294599 PANK1Q8TE04 598 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms