RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 PTPRKQ15262 1439 aa29.18■■■□□ 2.26
MALSU1-201ENST00000287543 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
MALSU1-201ENST00000287543 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.16■■■□□ 2.26
MALSU1-201ENST00000287543 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.16■■■□□ 2.26
MALSU1-201ENST00000287543 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.15■■■□□ 2.26
MALSU1-201ENST00000287543 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
MALSU1-201ENST00000287543 ERBINQ96RT1 1412 aa29.11■■■□□ 2.25
MALSU1-201ENST00000287543 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.11■■■□□ 2.25
MALSU1-201ENST00000287543 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
MALSU1-201ENST00000287543 PZPP20742 1482 aa29.08■■■□□ 2.25
MALSU1-201ENST00000287543 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
MALSU1-201ENST00000287543 NCOA1Q15788 1441 aa29.06■■■□□ 2.24
MALSU1-201ENST00000287543 TNRQ92752 1358 aa29.05■■■□□ 2.24
MALSU1-201ENST00000287543 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
MALSU1-201ENST00000287543 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
MALSU1-201ENST00000287543 ADGRL2O95490 1459 aa29.01■■■□□ 2.23
MALSU1-201ENST00000287543 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.01■■■□□ 2.23
MALSU1-201ENST00000287543 KANK1Q14678 1352 aa29.01■■■□□ 2.23
MALSU1-201ENST00000287543 PKD2Q13563 968 aa29■■■□□ 2.23
MALSU1-201ENST00000287543 PTPRTO14522 1441 aa29■■■□□ 2.23
MALSU1-201ENST00000287543 ABCC3O15438 1527 aa28.99■■■□□ 2.23
MALSU1-201ENST00000287543 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
MALSU1-201ENST00000287543 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.233e-6■□□□□ 9.9
MALSU1-201ENST00000287543 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
MALSU1-201ENST00000287543 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
MALSU1-201ENST00000287543 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.97■■■□□ 2.23
MALSU1-201ENST00000287543 PLA2R1Q13018 1463 aa28.95■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 NLRP1Q9C000 1473 aa28.93■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.93■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.93■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.92■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.91■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 ROCK1Q13464 1354 aa28.91■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 FBXO41Q8TF61 875 aa28.91■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.91■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.9■■■□□ 2.22
MALSU1-201ENST00000287543 CERKQ8TCT0 537 aa28.88■■■□□ 2.21
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
MALSU1-201ENST00000287543 STRCQ7RTU9 1775 aa28.88■■■□□ 2.21
MALSU1-201ENST00000287543 ERVK-7P63135 1459 aa28.85■■■□□ 2.21
MALSU1-201ENST00000287543 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.84■■■□□ 2.21
MALSU1-201ENST00000287543 ITGAEP38570 1179 aa28.83■■■□□ 2.21
MALSU1-201ENST00000287543 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.83■■■□□ 2.21
MALSU1-201ENST00000287543 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.82■■■□□ 2.2
MALSU1-201ENST00000287543 DEPDC5O75140 1603 aa28.81■■■□□ 2.2
MALSU1-201ENST00000287543 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
MALSU1-201ENST00000287543 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.78■■■□□ 2.2
MALSU1-201ENST00000287543 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.76■■■□□ 2.19
MALSU1-201ENST00000287543 CEP152O94986 1710 aa28.72■■■□□ 2.19
MALSU1-201ENST00000287543 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.7■■■□□ 2.18
MALSU1-201ENST00000287543 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.69■■■□□ 2.18
MALSU1-201ENST00000287543 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
MALSU1-201ENST00000287543 NOS1P29475 1434 aa28.66■■■□□ 2.18
MALSU1-201ENST00000287543 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.65■■■□□ 2.18
MALSU1-201ENST00000287543 IDI1Q13907 227 aa28.65■■■□□ 2.18
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
MALSU1-201ENST00000287543 EID1Q9Y6B2 187 aa28.64■■■□□ 2.18
MALSU1-201ENST00000287543 MED14O60244 1454 aa28.64■■■□□ 2.17
MALSU1-201ENST00000287543 NUP155O75694 1391 aa28.63■■■□□ 2.17
MALSU1-201ENST00000287543 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
MALSU1-201ENST00000287543 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.61■■■□□ 2.17
MALSU1-201ENST00000287543 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.61■■■□□ 2.17
MALSU1-201ENST00000287543 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.6■■■□□ 2.17
MALSU1-201ENST00000287543 UNC13BO14795 1591 aa28.58■■■□□ 2.17
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.57■■■□□ 2.16
MALSU1-201ENST00000287543 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.56■■■□□ 2.16
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.56■■■□□ 2.16
MALSU1-201ENST00000287543 SLIT1O75093 1534 aa28.55■■■□□ 2.16
MALSU1-201ENST00000287543 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
MALSU1-201ENST00000287543 LTKP29376 864 aa28.54■■■□□ 2.16
MALSU1-201ENST00000287543 TET3O43151 1660 aa28.53■■■□□ 2.16
MALSU1-201ENST00000287543 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
MALSU1-201ENST00000287543 NAIPQ13075 1403 aa28.52■■■□□ 2.16
MALSU1-201ENST00000287543 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
MALSU1-201ENST00000287543 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.51■■■□□ 2.15
MALSU1-201ENST00000287543 SYNMO15061 1565 aa28.5■■■□□ 2.15
MALSU1-201ENST00000287543 PIK3C2BO00750 1634 aa28.47■■■□□ 2.15
MALSU1-201ENST00000287543 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.47■■■□□ 2.15
MALSU1-201ENST00000287543 HFM1A2PYH4 1435 aa28.47■■■□□ 2.15
MALSU1-201ENST00000287543 CPS1P31327 1500 aa28.47■■■□□ 2.15
MALSU1-201ENST00000287543 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
MALSU1-201ENST00000287543 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
MALSU1-201ENST00000287543 ADGRB3O60242 1522 aa28.43■■■□□ 2.14
MALSU1-201ENST00000287543 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.43■■■□□ 2.14
MALSU1-201ENST00000287543 IQGAP1P46940 1657 aa28.42■■■□□ 2.14
MALSU1-201ENST00000287543 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
MALSU1-201ENST00000287543 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
MALSU1-201ENST00000287543 TRIM52Q96A61 297 aa28.41■■■□□ 2.14
MALSU1-201ENST00000287543 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.4■■■□□ 2.14
MALSU1-201ENST00000287543 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
MALSU1-201ENST00000287543 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
MALSU1-201ENST00000287543 BCANQ96GW7 911 aa28.36■■■□□ 2.13
MALSU1-201ENST00000287543 TOM1O60784 492 aa28.35■■■□□ 2.13
MALSU1-201ENST00000287543 E9PCH4 1651 aa28.35■■■□□ 2.13
MALSU1-201ENST00000287543 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.33■■■□□ 2.13
MALSU1-201ENST00000287543 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
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