RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
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USP25-201ENST00000285679 MS4A1P11836 297 aa19.86■□□□□ 0.77
USP25-201ENST00000285679 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
USP25-201ENST00000285679 KIAA0556O60303 1618 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-201ENST00000285679 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
USP25-201ENST00000285679 DISP1Q96F81 1524 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-201ENST00000285679 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.85■□□□□ 0.77
USP25-201ENST00000285679 PANK3Q9H999 370 aa19.84■□□□□ 0.77
USP25-201ENST00000285679 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
USP25-201ENST00000285679 BECN1Q14457 450 aa19.83■□□□□ 0.76
USP25-201ENST00000285679 PDE3BQ13370 1112 aa19.82■□□□□ 0.76
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USP25-201ENST00000285679 FAM161AQ3B820 660 aa19.8■□□□□ 0.76
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USP25-201ENST00000285679 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.8■□□□□ 0.76
USP25-201ENST00000285679 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.8■□□□□ 0.76
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USP25-201ENST00000285679 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.75■□□□□ 0.75
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USP25-201ENST00000285679 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.73■□□□□ 0.75
USP25-201ENST00000285679 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
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USP25-201ENST00000285679 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.71■□□□□ 0.75
USP25-201ENST00000285679 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.71■□□□□ 0.75
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USP25-201ENST00000285679 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa19.69■□□□□ 0.74
USP25-201ENST00000285679 COG6Q9Y2V7 657 aa19.69■□□□□ 0.74
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USP25-201ENST00000285679 ARHGEF11O15085 1522 aa19.68■□□□□ 0.74
USP25-201ENST00000285679 APAF1O14727 1248 aa19.68■□□□□ 0.74
USP25-201ENST00000285679 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
USP25-201ENST00000285679 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
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USP25-201ENST00000285679 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.63■□□□□ 0.73
USP25-201ENST00000285679 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
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USP25-201ENST00000285679 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.59■□□□□ 0.73
USP25-201ENST00000285679 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.59■□□□□ 0.73
USP25-201ENST00000285679 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.58■□□□□ 0.73
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USP25-201ENST00000285679 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.54■□□□□ 0.72
USP25-201ENST00000285679 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
USP25-201ENST00000285679 SLC24A1O60721 1099 aa19.54■□□□□ 0.72
USP25-201ENST00000285679 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.54■□□□□ 0.72
USP25-201ENST00000285679 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
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USP25-201ENST00000285679 CDCA8Q53HL2 280 aa19.51■□□□□ 0.71
USP25-201ENST00000285679 ATP10BO94823 1461 aa19.51■□□□□ 0.71
USP25-201ENST00000285679 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.5■□□□□ 0.71
USP25-201ENST00000285679 ABCA8O94911 1581 aa19.5■□□□□ 0.71
USP25-201ENST00000285679 PPP2R1AP30153 589 aa19.5■□□□□ 0.71
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USP25-201ENST00000285679 KDM5BQ9UGL1 1544 aa19.49■□□□□ 0.71
USP25-201ENST00000285679 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.48■□□□□ 0.71
USP25-201ENST00000285679 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
USP25-201ENST00000285679 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.712e-6■■■□□ 17
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USP25-201ENST00000285679 ROCK1Q13464 1354 aa19.47■□□□□ 0.71
USP25-201ENST00000285679 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
USP25-201ENST00000285679 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.46■□□□□ 0.71
USP25-201ENST00000285679 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.46■□□□□ 0.71
USP25-201ENST00000285679 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.45■□□□□ 0.7
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USP25-201ENST00000285679 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
USP25-201ENST00000285679 KIF14Q15058 1648 aa19.45■□□□□ 0.7
USP25-201ENST00000285679 MORC1Q86VD1 984 aa19.44■□□□□ 0.7
USP25-201ENST00000285679 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.44■□□□□ 0.7
USP25-201ENST00000285679 IGHDP01880 384 aa19.44■□□□□ 0.7
USP25-201ENST00000285679 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
USP25-201ENST00000285679 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.44■□□□□ 0.7
USP25-201ENST00000285679 SEC24BO95487 1268 aa19.43■□□□□ 0.7
USP25-201ENST00000285679 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
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