RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 PLA2R1Q13018 1463 aa21.76■■□□□ 1.07
SLC20A1-201ENST00000272542 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SLC20A1-201ENST00000272542 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC20A1-201ENST00000272542 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.71■■□□□ 1.07
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF3BO15066 747 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC20A1-201ENST00000272542 OSCARQ8IYS5 282 aa21.69■■□□□ 1.06
SLC20A1-201ENST00000272542 NEFLP07196 543 aa21.69■■□□□ 1.06
SLC20A1-201ENST00000272542 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.67■■□□□ 1.06
SLC20A1-201ENST00000272542 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.67■■□□□ 1.06
SLC20A1-201ENST00000272542 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SLC20A1-201ENST00000272542 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SLC20A1-201ENST00000272542 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.65■■□□□ 1.06
SLC20A1-201ENST00000272542 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.64■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.63■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 KDM5CP41229 1560 aa21.63■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 FANCAO15360 1455 aa21.61■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.61■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 ASXL2Q76L83 1435 aa21.61■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 A2MP01023 1474 aa21.61■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.6■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCC1P33527 1531 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.59■■□□□ 1.05
SLC20A1-201ENST00000272542 TMC1Q8TDI8 760 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 GGT6Q6P531 493 aa21.55■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 ADGRL1O94910 1474 aa21.54■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 ERBINQ96RT1 1412 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 RAPGEF3O95398 923 aa21.53■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 UNC13BO14795 1591 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 TESK2Q96S53 571 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 PLXNC1O60486 1568 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC20A1-201ENST00000272542 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC20A1-201ENST00000272542 PANK3Q9H999 370 aa21.49■■□□□ 1.03
SLC20A1-201ENST00000272542 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC20A1-201ENST00000272542 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SLC20A1-201ENST00000272542 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.47■■□□□ 1.03
SLC20A1-201ENST00000272542 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SLC20A1-201ENST00000272542 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.45■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.44■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ATP10AO60312 1499 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ATP7AQ04656 1500 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.42■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CD109Q6YHK3 1445 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 KANK1Q14678 1352 aa21.41■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 TMF1P82094 1093 aa21.4■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.4■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 E9PCH4 1651 aa21.4■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
SLC20A1-201ENST00000272542 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.38■■□□□ 1.01
SLC20A1-201ENST00000272542 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SLC20A1-201ENST00000272542 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.37■■□□□ 1.01
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.36■■□□□ 1.01
SLC20A1-201ENST00000272542 RALBP1Q15311 655 aa21.34■■□□□ 1.01
SLC20A1-201ENST00000272542 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.33■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.32■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 CLTCL1P53675 1640 aa21.31■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.3■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 PTPRTO14522 1441 aa21.3■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 NLRP13Q86W25 1043 aa21.3■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.28■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.27■■□□□ 1
SLC20A1-201ENST00000272542 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 TRPM2O94759 1503 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 NUDCQ9Y266 331 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.25■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.22■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.22■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.21■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.2■□□□□ 0.99
SLC20A1-201ENST00000272542 MADDQ8WXG6 1647 aa21.2■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 NOS1P29475 1434 aa21.2■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.2■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 NPATQ14207 1427 aa21.2■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.19■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 TET3O43151 1660 aa21.19■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 DEPDC5O75140 1603 aa21.19■□□□□ 0.98
SLC20A1-201ENST00000272542 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms