RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.42■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.42■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.41■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.4■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
COL5A3-201ENST00000264828 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.39■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 HMMRO75330 724 aa22.37■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.36■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.36■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 KIF3BO15066 747 aa22.35■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 ST18O60284 1047 aa22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 PHF14O94880 888 aa22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 KIF16BQ96L93 1317 aa22.34■■□□□ 1.17
COL5A3-201ENST00000264828 TOMM22Q9NS69 142 aa22.33■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.32■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.31■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 PLIN1O60240 522 aa22.31■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 TPM3P06753 285 aa22.3■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 RILPL2Q969X0 211 aa22.28■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.28■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
COL5A3-201ENST00000264828 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 H3BQV1 296 aa22.26■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 PDE4AP27815 886 aa22.26■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 IFFO2Q5TF58 517 aa22.26■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.25■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.25■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 NLRP13Q86W25 1043 aa22.25■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 VPS53Q5VIR6 699 aa22.24■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 JPH4Q96JJ6 628 aa22.24■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.24■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 GSE1Q14687 1217 aa22.24■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 FAM161AQ3B820 660 aa22.23■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.23■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.22■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.22■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 PDE3BQ13370 1112 aa22.22■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.21■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 CRBNQ96SW2 442 aa22.21■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 MARCH6O60337 910 aa22.2■■□□□ 1.15
COL5A3-201ENST00000264828 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF592Q92610 1267 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 EID1Q9Y6B2 187 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 CEP89Q96ST8 783 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 NUTM2FA1L443 756 aa22.2■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.19■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 AMPHP49418 695 aa22.19■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.19■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 G3V3G9 751 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 USP35Q9P2H5 1018 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 KIF15Q9NS87 1388 aa22.17■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.16■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 KIF3AQ9Y496 699 aa22.16■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 BECN2A8MW95 431 aa22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 MCTP1Q6DN14 999 aa22.15■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
COL5A3-201ENST00000264828 PANK3Q9H999 370 aa22.14■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 PRDM2Q13029 1718 aa22.13■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.13■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 COG6Q9Y2V7 657 aa22.13■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.12■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.11■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 WWC1Q8IX03 1113 aa22.1■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 PTPRGP23470 1445 aa22.1■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.09■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.08■■□□□ 1.13
COL5A3-201ENST00000264828 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.07■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.07■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.07■■□□□ 1.12
COL5A3-201ENST00000264828 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms