RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262288.7

SCPEP1-201, Transcript of serine carboxypeptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCPEP1, Length 1,942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1-201ENST00000262288 PLA2R1Q13018 1463 aa22.53■■□□□ 1.2
SCPEP1-201ENST00000262288 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.49■■□□□ 1.19
SCPEP1-201ENST00000262288 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.48■■□□□ 1.19
SCPEP1-201ENST00000262288 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.48■■□□□ 1.19
SCPEP1-201ENST00000262288 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.47■■□□□ 1.19
SCPEP1-201ENST00000262288 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.47■■□□□ 1.19
SCPEP1-201ENST00000262288 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.47■■□□□ 1.19
SCPEP1-201ENST00000262288 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SCPEP1-201ENST00000262288 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.47■■□□□ 1.19
SCPEP1-201ENST00000262288 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.46■■□□□ 1.19
SCPEP1-201ENST00000262288 KIF3BO15066 747 aa22.46■■□□□ 1.19
SCPEP1-201ENST00000262288 ANP32CO43423 234 aa22.46■■□□□ 1.19
SCPEP1-201ENST00000262288 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 DEPDC5O75140 1603 aa22.45■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.44■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 RGL3Q3MIN7 710 aa22.43■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.43■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 E9PCH4 1651 aa22.42■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 ATP10AO60312 1499 aa22.41■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.4■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 KDM5CP41229 1560 aa22.4■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 NEO1Q92859 1461 aa22.39■■□□□ 1.18
SCPEP1-201ENST00000262288 CCER2I3L3R5 266 aa22.38■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 KANK1Q14678 1352 aa22.38■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 CCDC7Q96M83 1385 aa22.38■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.38■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.37■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 RAPGEF3O95398 923 aa22.37■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.37■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.37■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.37■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 A2MP01023 1474 aa22.36■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 USP47Q96K76 1375 aa22.36■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 TET3O43151 1660 aa22.35■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.34■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 GLI2P10070 1586 aa22.34■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.34■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.34■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SCPEP1-201ENST00000262288 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.32■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.32■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 PTPRTO14522 1441 aa22.31■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.31■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.31■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.3■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 TRPM2O94759 1503 aa22.3■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 ABCA6Q8N139 1617 aa22.3■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.29■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.27■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 DIP2BQ9P265 1576 aa22.27■■□□□ 1.16
SCPEP1-201ENST00000262288 CLTCL1P53675 1640 aa22.26■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.26■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 RICTORQ6R327 1708 aa22.26■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 GGT6Q6P531 493 aa22.25■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 CEP152O94986 1710 aa22.24■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.23■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.22■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.22■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.21■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 TSPOAP1O95153 1857 aa22.21■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.21■■□□□ 1.15
SCPEP1-201ENST00000262288 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1-201ENST00000262288 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1-201ENST00000262288 LAMC1P11047 1609 aa22.18■■□□□ 1.14
SCPEP1-201ENST00000262288 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.17■■□□□ 1.14
SCPEP1-201ENST00000262288 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.15■■□□□ 1.14
SCPEP1-201ENST00000262288 MADDQ8WXG6 1647 aa22.12■■□□□ 1.13
SCPEP1-201ENST00000262288 ABCC3O15438 1527 aa22.12■■□□□ 1.13
SCPEP1-201ENST00000262288 NPATQ14207 1427 aa22.12■■□□□ 1.13
SCPEP1-201ENST00000262288 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SCPEP1-201ENST00000262288 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SCPEP1-201ENST00000262288 STAC3Q96MF2 364 aa22.1■■□□□ 1.13
SCPEP1-201ENST00000262288 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.1■■□□□ 1.13
SCPEP1-201ENST00000262288 KIF1BO60333 1816 aa22.1■■□□□ 1.13
SCPEP1-201ENST00000262288 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.08■■□□□ 1.12
SCPEP1-201ENST00000262288 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.07■■□□□ 1.12
SCPEP1-201ENST00000262288 MROH2AA6NES4 1674 aa22.06■■□□□ 1.12
SCPEP1-201ENST00000262288 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.05■■□□□ 1.12
SCPEP1-201ENST00000262288 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SCPEP1-201ENST00000262288 CCDC184Q52MB2 194 aa22.05■■□□□ 1.12
SCPEP1-201ENST00000262288 TESK2Q96S53 571 aa22.04■■□□□ 1.12
SCPEP1-201ENST00000262288 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.03■■□□□ 1.12
SCPEP1-201ENST00000262288 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.03■■□□□ 1.12
SCPEP1-201ENST00000262288 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SCPEP1-201ENST00000262288 ADGRB3O60242 1522 aa22■■□□□ 1.11
SCPEP1-201ENST00000262288 IFT172Q9UG01 1749 aa22■■□□□ 1.11
SCPEP1-201ENST00000262288 NOS1P29475 1434 aa21.99■■□□□ 1.11
SCPEP1-201ENST00000262288 MYOM2P54296 1465 aa21.99■■□□□ 1.11
SCPEP1-201ENST00000262288 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.99■■□□□ 1.11
SCPEP1-201ENST00000262288 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.98■■□□□ 1.11
SCPEP1-201ENST00000262288 IQGAP1P46940 1657 aa21.98■■□□□ 1.11
SCPEP1-201ENST00000262288 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.98■■□□□ 1.11
SCPEP1-201ENST00000262288 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SCPEP1-201ENST00000262288 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms