RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259983.7

C6orf52-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 52, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene C6orf52, Length 619 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf52-201ENST00000259983 TSPY4P0CV99 314 aa22.52■■□□□ 1.2
C6orf52-201ENST00000259983 TSPY10P0CW01 314 aa22.52■■□□□ 1.2
C6orf52-201ENST00000259983 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.52■■□□□ 1.19
C6orf52-201ENST00000259983 KIF3BO15066 747 aa22.51■■□□□ 1.19
C6orf52-201ENST00000259983 PZPP20742 1482 aa22.47■■□□□ 1.19
C6orf52-201ENST00000259983 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.47■■□□□ 1.19
C6orf52-201ENST00000259983 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
C6orf52-201ENST00000259983 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.46■■□□□ 1.19
C6orf52-201ENST00000259983 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
C6orf52-201ENST00000259983 PKD2Q13563 968 aa22.45■■□□□ 1.18
C6orf52-201ENST00000259983 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
C6orf52-201ENST00000259983 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.43■■□□□ 1.18
C6orf52-201ENST00000259983 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.42■■□□□ 1.18
C6orf52-201ENST00000259983 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
C6orf52-201ENST00000259983 TNRQ92752 1358 aa22.41■■□□□ 1.18
C6orf52-201ENST00000259983 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
C6orf52-201ENST00000259983 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.39■■□□□ 1.18
C6orf52-201ENST00000259983 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.39■■□□□ 1.17
C6orf52-201ENST00000259983 APLP2Q06481 763 aa22.38■■□□□ 1.17
C6orf52-201ENST00000259983 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
C6orf52-201ENST00000259983 ABCC3O15438 1527 aa22.37■■□□□ 1.17
C6orf52-201ENST00000259983 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.37■■□□□ 1.17
C6orf52-201ENST00000259983 NLRP1Q9C000 1473 aa22.36■■□□□ 1.17
C6orf52-201ENST00000259983 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.36■■□□□ 1.17
C6orf52-201ENST00000259983 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.36■■□□□ 1.17
C6orf52-201ENST00000259983 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.35■■□□□ 1.17
C6orf52-201ENST00000259983 ABCC5O15440 1437 aa22.34■■□□□ 1.17
C6orf52-201ENST00000259983 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.32■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.32■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 ERBINQ96RT1 1412 aa22.31■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 KIF15Q9NS87 1388 aa22.3■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.29■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 DAPK1P53355 1430 aa22.29■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.28■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 ERVK-7P63135 1459 aa22.28■■□□□ 1.16
C6orf52-201ENST00000259983 CEP152O94986 1710 aa22.26■■□□□ 1.15
C6orf52-201ENST00000259983 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.25■■□□□ 1.15
C6orf52-201ENST00000259983 DEPDC5O75140 1603 aa22.25■■□□□ 1.15
C6orf52-201ENST00000259983 MED14O60244 1454 aa22.24■■□□□ 1.15
C6orf52-201ENST00000259983 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
C6orf52-201ENST00000259983 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.23■■□□□ 1.15
C6orf52-201ENST00000259983 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.21■■□□□ 1.15
C6orf52-201ENST00000259983 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.2■■□□□ 1.14
C6orf52-201ENST00000259983 CPS1P31327 1500 aa22.19■■□□□ 1.14
C6orf52-201ENST00000259983 ADGRL2O95490 1459 aa22.18■■□□□ 1.14
C6orf52-201ENST00000259983 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
C6orf52-201ENST00000259983 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
C6orf52-201ENST00000259983 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.16■■□□□ 1.14
C6orf52-201ENST00000259983 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.16■■□□□ 1.14
C6orf52-201ENST00000259983 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.16■■□□□ 1.14
C6orf52-201ENST00000259983 KANK1Q14678 1352 aa22.14■■□□□ 1.14
C6orf52-201ENST00000259983 IQGAP1P46940 1657 aa22.14■■□□□ 1.14
C6orf52-201ENST00000259983 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.12■■□□□ 1.13
C6orf52-201ENST00000259983 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.11■■□□□ 1.13
C6orf52-201ENST00000259983 SLIT1O75093 1534 aa22.11■■□□□ 1.13
C6orf52-201ENST00000259983 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.1■■□□□ 1.13
C6orf52-201ENST00000259983 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
C6orf52-201ENST00000259983 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
C6orf52-201ENST00000259983 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
C6orf52-201ENST00000259983 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.06■■□□□ 1.12
C6orf52-201ENST00000259983 PIK3C2BO00750 1634 aa22.06■■□□□ 1.12
C6orf52-201ENST00000259983 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
C6orf52-201ENST00000259983 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.05■■□□□ 1.12
C6orf52-201ENST00000259983 NOS1P29475 1434 aa22.04■■□□□ 1.12
C6orf52-201ENST00000259983 LTKP29376 864 aa22.02■■□□□ 1.12
C6orf52-201ENST00000259983 SYNMO15061 1565 aa22.02■■□□□ 1.12
C6orf52-201ENST00000259983 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
C6orf52-201ENST00000259983 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.02■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.01■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.01■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 TOM1O60784 492 aa22.01■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.99■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.98■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 IDI1Q13907 227 aa21.98■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 EID1Q9Y6B2 187 aa21.98■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 ROCK1Q13464 1354 aa21.98■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 ALKQ9UM73 1620 aa21.97■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 TET3O43151 1660 aa21.97■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 UNC13BO14795 1591 aa21.96■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.96■■□□□ 1.11
C6orf52-201ENST00000259983 ADGRB3O60242 1522 aa21.95■■□□□ 1.1
C6orf52-201ENST00000259983 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.94■■□□□ 1.1
C6orf52-201ENST00000259983 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.93■■□□□ 1.1
C6orf52-201ENST00000259983 PIP4K2BP78356 416 aa21.89■■□□□ 1.09
C6orf52-201ENST00000259983 ILDR2Q71H61 639 aa21.89■■□□□ 1.09
C6orf52-201ENST00000259983 HSPA1LP34931 641 aa21.88■■□□□ 1.09
C6orf52-201ENST00000259983 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.88■■□□□ 1.09
C6orf52-201ENST00000259983 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
C6orf52-201ENST00000259983 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
C6orf52-201ENST00000259983 ZFYVE9O95405 1425 aa21.85■■□□□ 1.09
C6orf52-201ENST00000259983 E9PCH4 1651 aa21.84■■□□□ 1.09
C6orf52-201ENST00000259983 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.84■■□□□ 1.09
C6orf52-201ENST00000259983 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.82■■□□□ 1.08
C6orf52-201ENST00000259983 KCNA6P17658 529 aa21.81■■□□□ 1.08
C6orf52-201ENST00000259983 NWD1Q149M9 1564 aa21.81■■□□□ 1.08
C6orf52-201ENST00000259983 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms