RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGEF11O15085 1522 aa17.69■□□□□ 0.42
TMOD1-201ENST00000259365 WDR62O43379 1518 aa17.68■□□□□ 0.42
TMOD1-201ENST00000259365 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.67■□□□□ 0.42
TMOD1-201ENST00000259365 TMF1P82094 1093 aa17.67■□□□□ 0.42
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.66■□□□□ 0.42
TMOD1-201ENST00000259365 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.66■□□□□ 0.42
TMOD1-201ENST00000259365 DISP1Q96F81 1524 aa17.65■□□□□ 0.42
TMOD1-201ENST00000259365 CANXP27824 592 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.64■□□□□ 0.41
TMOD1-201ENST00000259365 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.63■□□□□ 0.41
TMOD1-201ENST00000259365 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
TMOD1-201ENST00000259365 ARXQ96QS3 562 aa17.6■□□□□ 0.41
TMOD1-201ENST00000259365 GRIN2AQ12879 1464 aa17.6■□□□□ 0.41
TMOD1-201ENST00000259365 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
TMOD1-201ENST00000259365 GCC2Q8IWJ2 1684 aa17.59■□□□□ 0.41
TMOD1-201ENST00000259365 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
TMOD1-201ENST00000259365 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
TMOD1-201ENST00000259365 PTPRGP23470 1445 aa17.58■□□□□ 0.41
TMOD1-201ENST00000259365 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.57■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 ADAMTS12P58397 1594 aa17.57■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 AFAP1Q8N556 730 aa17.57■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 KIF14Q15058 1648 aa17.56■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.56■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 APAF1O14727 1248 aa17.56■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 IL27Q8NEV9 243 aa17.55■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 IFT140Q96RY7 1462 aa17.54■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.54■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 BACH2Q9BYV9 841 aa17.54■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA0556O60303 1618 aa17.53■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.53■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 BCL2L13Q9BXK5 485 aa17.52■□□□□ 0.4
TMOD1-201ENST00000259365 PBRM1Q86U86 1689 aa17.52■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 BCAR3O75815 825 aa17.51■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 PDE3BQ13370 1112 aa17.51■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 RNF123Q5XPI4 1314 aa17.51■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA2Q08379 1002 aa17.5■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 ATP10BO94823 1461 aa17.5■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 PPP2R1AP30153 589 aa17.5■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 TESK2Q96S53 571 aa17.5■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 KIF3BO15066 747 aa17.49■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 CLUAP1Q96AJ1 413 aa17.49■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.48■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 CFAP70Q5T0N1 1121 aa17.47■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
TMOD1-201ENST00000259365 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 COG6Q9Y2V7 657 aa17.45■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 TRAK1Q9UPV9 953 aa17.44■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.44■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.44■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 PANK1Q8TE04 598 aa17.43■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.43■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 ERBINQ96RT1 1412 aa17.42■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 GGT6Q6P531 493 aa17.41■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.4■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 PARD3Q8TEW0 1356 aa17.4■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 KDM5CP41229 1560 aa17.4■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.4■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.39■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.39■□□□□ 0.38
TMOD1-201ENST00000259365 DUSP27Q5VZP5 1158 aa17.39■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 SYNJ2O15056 1496 aa17.39■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.39■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.39■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 MBD5Q9P267 1494 aa17.39■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.38■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 BRPF3Q9ULD4 1205 aa17.38■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 MORC1Q86VD1 984 aa17.37■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 MS4A1P11836 297 aa17.37■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 CDCA8Q53HL2 280 aa17.37■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 NFKBIBQ15653 356 aa17.36■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 CEP170Q5SW79 1584 aa17.36■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 STK26Q9P289 416 aa17.36■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.35■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.34■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 FAM161AQ3B820 660 aa17.34■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa17.34■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.33■□□□□ 0.37
TMOD1-201ENST00000259365 TNNQ9UQP3 1299 aa17.32■□□□□ 0.36
TMOD1-201ENST00000259365 ADGRL2O95490 1459 aa17.32■□□□□ 0.36
TMOD1-201ENST00000259365 IGHDP01880 384 aa17.32■□□□□ 0.36
TMOD1-201ENST00000259365 A2MP01023 1474 aa17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms