RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 TSPOAP1O95153 1857 aa30.32■■■□□ 2.44
RFXAP-201ENST00000255476 KDM5CP41229 1560 aa30.32■■■□□ 2.44
RFXAP-201ENST00000255476 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.27■■■□□ 2.44
RFXAP-201ENST00000255476 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
RFXAP-201ENST00000255476 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.25■■■□□ 2.43
RFXAP-201ENST00000255476 KIF3BO15066 747 aa30.25■■■□□ 2.43
RFXAP-201ENST00000255476 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.24■■■□□ 2.43
RFXAP-201ENST00000255476 DEPDC5O75140 1603 aa30.22■■■□□ 2.43
RFXAP-201ENST00000255476 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
RFXAP-201ENST00000255476 RICTORQ6R327 1708 aa30.22■■■□□ 2.43
RFXAP-201ENST00000255476 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.19■■■□□ 2.42
RFXAP-201ENST00000255476 A2MP01023 1474 aa30.19■■■□□ 2.42
RFXAP-201ENST00000255476 ABCA6Q8N139 1617 aa30.18■■■□□ 2.42
RFXAP-201ENST00000255476 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
RFXAP-201ENST00000255476 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
RFXAP-201ENST00000255476 PLA2R1Q13018 1463 aa30.17■■■□□ 2.42
RFXAP-201ENST00000255476 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.15■■■□□ 2.42
RFXAP-201ENST00000255476 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.14■■■□□ 2.42
RFXAP-201ENST00000255476 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.14■■■□□ 2.42
RFXAP-201ENST00000255476 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
RFXAP-201ENST00000255476 E9PCH4 1651 aa30.12■■■□□ 2.41
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.1■■■□□ 2.41
RFXAP-201ENST00000255476 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
RFXAP-201ENST00000255476 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.1■■■□□ 2.41
RFXAP-201ENST00000255476 KANK1Q14678 1352 aa30.09■■■□□ 2.41
RFXAP-201ENST00000255476 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.08■■■□□ 2.41
RFXAP-201ENST00000255476 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.07■■■□□ 2.4
RFXAP-201ENST00000255476 TET3O43151 1660 aa30.06■■■□□ 2.4
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
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RFXAP-201ENST00000255476 ATP10AO60312 1499 aa30.03■■■□□ 2.4
RFXAP-201ENST00000255476 GGT6Q6P531 493 aa30.02■■■□□ 2.4
RFXAP-201ENST00000255476 CEP152O94986 1710 aa30■■■□□ 2.39
RFXAP-201ENST00000255476 RGL3Q3MIN7 710 aa29.99■■■□□ 2.39
RFXAP-201ENST00000255476 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.99■■■□□ 2.39
RFXAP-201ENST00000255476 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.98■■■□□ 2.39
RFXAP-201ENST00000255476 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.98■■■□□ 2.39
RFXAP-201ENST00000255476 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.97■■■□□ 2.39
RFXAP-201ENST00000255476 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.97■■■□□ 2.39
RFXAP-201ENST00000255476 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
RFXAP-201ENST00000255476 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
RFXAP-201ENST00000255476 PTPRTO14522 1441 aa29.93■■■□□ 2.38
RFXAP-201ENST00000255476 TRPM2O94759 1503 aa29.93■■■□□ 2.38
RFXAP-201ENST00000255476 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.93■■■□□ 2.38
RFXAP-201ENST00000255476 MYT1Q01538 1121 aa29.92■■■□□ 2.38
RFXAP-201ENST00000255476 MIER1Q8N108 512 aa29.92■■■□□ 2.38
RFXAP-201ENST00000255476 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
RFXAP-201ENST00000255476 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.9■■■□□ 2.38
RFXAP-201ENST00000255476 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
RFXAP-201ENST00000255476 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.89■■■□□ 2.38
RFXAP-201ENST00000255476 CLTCL1P53675 1640 aa29.89■■■□□ 2.37
RFXAP-201ENST00000255476 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.87■■■□□ 2.37
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RFXAP-201ENST00000255476 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.84■■■□□ 2.37
RFXAP-201ENST00000255476 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.83■■■□□ 2.37
RFXAP-201ENST00000255476 NPATQ14207 1427 aa29.82■■■□□ 2.36
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RFXAP-201ENST00000255476 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.78■■■□□ 2.36
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RFXAP-201ENST00000255476 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.76■■■□□ 2.36
RFXAP-201ENST00000255476 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.73■■■□□ 2.35
RFXAP-201ENST00000255476 USP47Q96K76 1375 aa29.73■■■□□ 2.35
RFXAP-201ENST00000255476 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
RFXAP-201ENST00000255476 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.72■■■□□ 2.35
RFXAP-201ENST00000255476 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.71■■■□□ 2.35
RFXAP-201ENST00000255476 REREQ9P2R6 1566 aa29.71■■■□□ 2.35
RFXAP-201ENST00000255476 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.7■■■□□ 2.35
RFXAP-201ENST00000255476 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
RFXAP-201ENST00000255476 KIF1BO60333 1816 aa29.7■■■□□ 2.34
RFXAP-201ENST00000255476 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
RFXAP-201ENST00000255476 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.68■■■□□ 2.34
RFXAP-201ENST00000255476 AGLP35573 1532 aa29.66■■■□□ 2.34
RFXAP-201ENST00000255476 MROH2AA6NES4 1674 aa29.65■■■□□ 2.34
RFXAP-201ENST00000255476 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.65■■■□□ 2.34
RFXAP-201ENST00000255476 MLECQ14165 292 aa29.64■■■□□ 2.34
RFXAP-201ENST00000255476 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.64■■■□□ 2.33
RFXAP-201ENST00000255476 NOS1P29475 1434 aa29.62■■■□□ 2.33
RFXAP-201ENST00000255476 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.62■■■□□ 2.33
RFXAP-201ENST00000255476 MADDQ8WXG6 1647 aa29.61■■■□□ 2.33
RFXAP-201ENST00000255476 SYNMO15061 1565 aa29.6■■■□□ 2.33
RFXAP-201ENST00000255476 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.6■■■□□ 2.33
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC7Q96M83 1385 aa29.59■■■□□ 2.33
RFXAP-201ENST00000255476 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.56■■■□□ 2.32
RFXAP-201ENST00000255476 ADGRB3O60242 1522 aa29.56■■■□□ 2.32
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RFXAP-201ENST00000255476 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.54■■■□□ 2.32
RFXAP-201ENST00000255476 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
RFXAP-201ENST00000255476 PIK3C2BO00750 1634 aa29.53■■■□□ 2.32
RFXAP-201ENST00000255476 IFT172Q9UG01 1749 aa29.53■■■□□ 2.32
RFXAP-201ENST00000255476 STAC3Q96MF2 364 aa29.51■■■□□ 2.31
RFXAP-201ENST00000255476 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.51■■■□□ 2.31
RFXAP-201ENST00000255476 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.5■■■□□ 2.31
RFXAP-201ENST00000255476 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
RFXAP-201ENST00000255476 IDI1Q13907 227 aa29.49■■■□□ 2.31
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