RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 H3BQV1 296 aa25.41■■□□□ 1.66
ZBED3-201ENST00000255198 IFFO2Q5TF58 517 aa25.41■■□□□ 1.66
ZBED3-201ENST00000255198 RILPL2Q969X0 211 aa25.41■■□□□ 1.66
ZBED3-201ENST00000255198 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.39■■□□□ 1.66
ZBED3-201ENST00000255198 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
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ZBED3-201ENST00000255198 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.39■■□□□ 1.65
ZBED3-201ENST00000255198 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.38■■□□□ 1.65
ZBED3-201ENST00000255198 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
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ZBED3-201ENST00000255198 ST18O60284 1047 aa25.36■■□□□ 1.65
ZBED3-201ENST00000255198 NGEFQ8N5V2 710 aa25.36■■□□□ 1.65
ZBED3-201ENST00000255198 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.34■■□□□ 1.65
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ZBED3-201ENST00000255198 PHF14O94880 888 aa25.32■■□□□ 1.64
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ZBED3-201ENST00000255198 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.32■■□□□ 1.64
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ZBED3-201ENST00000255198 KIF3AQ9Y496 699 aa25.29■■□□□ 1.64
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ZBED3-201ENST00000255198 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.28■■□□□ 1.64
ZBED3-201ENST00000255198 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
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ZBED3-201ENST00000255198 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.27■■□□□ 1.64
ZBED3-201ENST00000255198 TPM2P07951 284 aa25.26■■□□□ 1.63
ZBED3-201ENST00000255198 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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ZBED3-201ENST00000255198 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ZBED3-201ENST00000255198 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.25■■□□□ 1.63
ZBED3-201ENST00000255198 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
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ZBED3-201ENST00000255198 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.24■■□□□ 1.63
ZBED3-201ENST00000255198 USP35Q9P2H5 1018 aa25.24■■□□□ 1.63
ZBED3-201ENST00000255198 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.23■■□□□ 1.63
ZBED3-201ENST00000255198 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.23■■□□□ 1.63
ZBED3-201ENST00000255198 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.22■■□□□ 1.63
ZBED3-201ENST00000255198 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.22■■□□□ 1.63
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ZBED3-201ENST00000255198 BECN2A8MW95 431 aa25.21■■□□□ 1.63
ZBED3-201ENST00000255198 SLC4A3P48751 1232 aa25.21■■□□□ 1.63
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF592Q92610 1267 aa25.21■■□□□ 1.63
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ZBED3-201ENST00000255198 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
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ZBED3-201ENST00000255198 TPM1P09493 284 aa25.19■■□□□ 1.62
ZBED3-201ENST00000255198 APPP05067 770 aa25.18■■□□□ 1.62
ZBED3-201ENST00000255198 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.18■■□□□ 1.62
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ZBED3-201ENST00000255198 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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ZBED3-201ENST00000255198 PLIN1O60240 522 aa25.15■■□□□ 1.62
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ZBED3-201ENST00000255198 PANK3Q9H999 370 aa25.06■■□□□ 1.6
ZBED3-201ENST00000255198 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.05■■□□□ 1.6
ZBED3-201ENST00000255198 CPLX1O14810 134 aa25.05■■□□□ 1.6
ZBED3-201ENST00000255198 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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ZBED3-201ENST00000255198 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ZBED3-201ENST00000255198 GPS2Q13227 327 aa25.03■■□□□ 1.6
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