RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.16■■□□□ 1.46
TVP23C-201ENST00000225576 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.461e-7■□□□□ 8.3
TVP23C-201ENST00000225576 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.14■■□□□ 1.45
TVP23C-201ENST00000225576 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.14■■□□□ 1.45
TVP23C-201ENST00000225576 RAPGEF3O95398 923 aa24.13■■□□□ 1.45
TVP23C-201ENST00000225576 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TVP23C-201ENST00000225576 A2MP01023 1474 aa24.11■■□□□ 1.45
TVP23C-201ENST00000225576 DEPDC5O75140 1603 aa24.09■■□□□ 1.45
TVP23C-201ENST00000225576 KIF3BO15066 747 aa24.08■■□□□ 1.45
TVP23C-201ENST00000225576 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.08■■□□□ 1.45
TVP23C-201ENST00000225576 RICTORQ6R327 1708 aa24.08■■□□□ 1.44
TVP23C-201ENST00000225576 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
TVP23C-201ENST00000225576 KANK1Q14678 1352 aa24.06■■□□□ 1.44
TVP23C-201ENST00000225576 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.04■■□□□ 1.44
TVP23C-201ENST00000225576 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TVP23C-201ENST00000225576 ATP10AO60312 1499 aa24.02■■□□□ 1.44
TVP23C-201ENST00000225576 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TVP23C-201ENST00000225576 ABCA6Q8N139 1617 aa24.02■■□□□ 1.44
TVP23C-201ENST00000225576 TSPOAP1O95153 1857 aa24.01■■□□□ 1.43
TVP23C-201ENST00000225576 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.01■■□□□ 1.43
TVP23C-201ENST00000225576 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.01■■□□□ 1.43
TVP23C-201ENST00000225576 PLA2R1Q13018 1463 aa23.99■■□□□ 1.43
TVP23C-201ENST00000225576 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.99■■□□□ 1.43
TVP23C-201ENST00000225576 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.99■■□□□ 1.43
TVP23C-201ENST00000225576 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TVP23C-201ENST00000225576 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.97■■□□□ 1.43
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.97■■□□□ 1.43
TVP23C-201ENST00000225576 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
TVP23C-201ENST00000225576 TET3O43151 1660 aa23.95■■□□□ 1.43
TVP23C-201ENST00000225576 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.95■■□□□ 1.42
TVP23C-201ENST00000225576 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.93■■□□□ 1.42
TVP23C-201ENST00000225576 PTPRTO14522 1441 aa23.92■■□□□ 1.42
TVP23C-201ENST00000225576 E9PCH4 1651 aa23.91■■□□□ 1.42
TVP23C-201ENST00000225576 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.89■■□□□ 1.41
TVP23C-201ENST00000225576 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
TVP23C-201ENST00000225576 GGT6Q6P531 493 aa23.87■■□□□ 1.41
TVP23C-201ENST00000225576 TRPM2O94759 1503 aa23.86■■□□□ 1.41
TVP23C-201ENST00000225576 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.86■■□□□ 1.41
TVP23C-201ENST00000225576 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.86■■□□□ 1.41
TVP23C-201ENST00000225576 REREQ9P2R6 1566 aa23.84■■□□□ 1.41
TVP23C-201ENST00000225576 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.81■■□□□ 1.4
TVP23C-201ENST00000225576 ABCC3O15438 1527 aa23.81■■□□□ 1.4
TVP23C-201ENST00000225576 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.8■■□□□ 1.4
TVP23C-201ENST00000225576 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.79■■□□□ 1.4
TVP23C-201ENST00000225576 AGLP35573 1532 aa23.79■■□□□ 1.4
TVP23C-201ENST00000225576 CEP152O94986 1710 aa23.78■■□□□ 1.4
TVP23C-201ENST00000225576 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.77■■□□□ 1.4
TVP23C-201ENST00000225576 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
TVP23C-201ENST00000225576 NPATQ14207 1427 aa23.76■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 RGL3Q3MIN7 710 aa23.75■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.75■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.75■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.74■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.74■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 CLTCL1P53675 1640 aa23.73■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.73■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 STAC3Q96MF2 364 aa23.73■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.72■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.71■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.71■■□□□ 1.39
TVP23C-201ENST00000225576 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.7■■□□□ 1.38
TVP23C-201ENST00000225576 NOS1P29475 1434 aa23.68■■□□□ 1.38
TVP23C-201ENST00000225576 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.63■■□□□ 1.37
TVP23C-201ENST00000225576 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.61■■□□□ 1.37
TVP23C-201ENST00000225576 USP47Q96K76 1375 aa23.6■■□□□ 1.37
TVP23C-201ENST00000225576 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.59■■□□□ 1.37
TVP23C-201ENST00000225576 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TVP23C-201ENST00000225576 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.59■■□□□ 1.37
TVP23C-201ENST00000225576 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.58■■□□□ 1.37
TVP23C-201ENST00000225576 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 KIF1BO60333 1816 aa23.57■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 ADGRB3O60242 1522 aa23.57■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 MIER1Q8N108 512 aa23.57■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.57■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 SYNMO15061 1565 aa23.55■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 PIK3C2BO00750 1634 aa23.54■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 MYOM2P54296 1465 aa23.54■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.53■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.53■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 MADDQ8WXG6 1647 aa23.53■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 MLECQ14165 292 aa23.53■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.53■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 LAMC1P11047 1609 aa23.52■■□□□ 1.36
TVP23C-201ENST00000225576 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.5■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 MROH2AA6NES4 1674 aa23.5■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 ERVK-7P63135 1459 aa23.5■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 IDI1Q13907 227 aa23.49■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC7Q96M83 1385 aa23.49■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.47■■□□□ 1.35
TVP23C-201ENST00000225576 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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