RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.05■■□□□ 1.92
PLGRKT-201ENST00000223864 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.02■■□□□ 1.92
PLGRKT-201ENST00000223864 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.01■■□□□ 1.91
PLGRKT-201ENST00000223864 PLXNC1O60486 1568 aa27.01■■□□□ 1.91
PLGRKT-201ENST00000223864 A2MP01023 1474 aa27■■□□□ 1.91
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27■■□□□ 1.91
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGEF5Q12774 1597 aa27■■□□□ 1.91
PLGRKT-201ENST00000223864 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.98■■□□□ 1.91
PLGRKT-201ENST00000223864 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.97■■□□□ 1.91
PLGRKT-201ENST00000223864 MIA2Q96PC5 1412 aa26.97■■□□□ 1.91
PLGRKT-201ENST00000223864 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PLGRKT-201ENST00000223864 C3P01024 1663 aa26.95■■□□□ 1.91
PLGRKT-201ENST00000223864 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PLGRKT-201ENST00000223864 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PLGRKT-201ENST00000223864 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.92■■□□□ 1.9
PLGRKT-201ENST00000223864 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.91■■□□□ 1.9
PLGRKT-201ENST00000223864 MROH2AA6NES4 1674 aa26.9■■□□□ 1.9
PLGRKT-201ENST00000223864 TSPY4P0CV99 314 aa26.89■■□□□ 1.9
PLGRKT-201ENST00000223864 TSPY10P0CW01 314 aa26.89■■□□□ 1.9
PLGRKT-201ENST00000223864 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PLGRKT-201ENST00000223864 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.86■■□□□ 1.89
PLGRKT-201ENST00000223864 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PLGRKT-201ENST00000223864 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.83■■□□□ 1.89
PLGRKT-201ENST00000223864 GGT6Q6P531 493 aa26.83■■□□□ 1.89
PLGRKT-201ENST00000223864 HSPA2P54652 639 aa26.81■■□□□ 1.88
PLGRKT-201ENST00000223864 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PLGRKT-201ENST00000223864 ZMYM3Q14202 1370 aa26.79■■□□□ 1.88
PLGRKT-201ENST00000223864 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.78■■□□□ 1.88
PLGRKT-201ENST00000223864 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.77■■□□□ 1.88
PLGRKT-201ENST00000223864 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.77■■□□□ 1.88
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF3BO15066 747 aa26.76■■□□□ 1.87
PLGRKT-201ENST00000223864 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PLGRKT-201ENST00000223864 NPATQ14207 1427 aa26.74■■□□□ 1.87
PLGRKT-201ENST00000223864 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.71■■□□□ 1.87
PLGRKT-201ENST00000223864 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.71■■□□□ 1.87
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCC5O15440 1437 aa26.71■■□□□ 1.87
PLGRKT-201ENST00000223864 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PLGRKT-201ENST00000223864 DAPK1P53355 1430 aa26.68■■□□□ 1.86
PLGRKT-201ENST00000223864 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PLGRKT-201ENST00000223864 PTPRKQ15262 1439 aa26.66■■□□□ 1.86
PLGRKT-201ENST00000223864 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.66■■□□□ 1.86
PLGRKT-201ENST00000223864 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.66■■□□□ 1.86
PLGRKT-201ENST00000223864 STRCQ7RTU9 1775 aa26.66■■□□□ 1.86
PLGRKT-201ENST00000223864 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.63■■□□□ 1.85
PLGRKT-201ENST00000223864 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.61■■□□□ 1.85
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF15Q9NS87 1388 aa26.6■■□□□ 1.85
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PLGRKT-201ENST00000223864 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PLGRKT-201ENST00000223864 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.58■■□□□ 1.85
PLGRKT-201ENST00000223864 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.57■■□□□ 1.84
PLGRKT-201ENST00000223864 PZPP20742 1482 aa26.56■■□□□ 1.84
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.56■■□□□ 1.84
PLGRKT-201ENST00000223864 ERBINQ96RT1 1412 aa26.56■■□□□ 1.84
PLGRKT-201ENST00000223864 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PLGRKT-201ENST00000223864 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.54■■□□□ 1.84
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCC3O15438 1527 aa26.54■■□□□ 1.84
PLGRKT-201ENST00000223864 CEP152O94986 1710 aa26.53■■□□□ 1.84
PLGRKT-201ENST00000223864 NCOA1Q15788 1441 aa26.52■■□□□ 1.84
PLGRKT-201ENST00000223864 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.51■■□□□ 1.83
PLGRKT-201ENST00000223864 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
PLGRKT-201ENST00000223864 ADGRL2O95490 1459 aa26.5■■□□□ 1.83
PLGRKT-201ENST00000223864 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PLGRKT-201ENST00000223864 DEPDC5O75140 1603 aa26.5■■□□□ 1.83
PLGRKT-201ENST00000223864 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PLGRKT-201ENST00000223864 TNRQ92752 1358 aa26.49■■□□□ 1.83
PLGRKT-201ENST00000223864 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.48■■□□□ 1.83
PLGRKT-201ENST00000223864 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PLGRKT-201ENST00000223864 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PLGRKT-201ENST00000223864 PTPRTO14522 1441 aa26.46■■□□□ 1.83
PLGRKT-201ENST00000223864 PLA2R1Q13018 1463 aa26.43■■□□□ 1.82
PLGRKT-201ENST00000223864 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.41■■□□□ 1.82
PLGRKT-201ENST00000223864 KANK1Q14678 1352 aa26.4■■□□□ 1.82
PLGRKT-201ENST00000223864 NLRP1Q9C000 1473 aa26.4■■□□□ 1.82
PLGRKT-201ENST00000223864 ERVK-7P63135 1459 aa26.38■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.38■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 PKD2Q13563 968 aa26.37■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.37■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.37■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.36■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 FBXO41Q8TF61 875 aa26.35■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.34■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 ROCK1Q13464 1354 aa26.33■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 CERKQ8TCT0 537 aa26.33■■□□□ 1.81
PLGRKT-201ENST00000223864 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.33■■□□□ 1.8
PLGRKT-201ENST00000223864 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PLGRKT-201ENST00000223864 ITGAEP38570 1179 aa26.27■■□□□ 1.8
PLGRKT-201ENST00000223864 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.27■■□□□ 1.8
PLGRKT-201ENST00000223864 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PLGRKT-201ENST00000223864 UNC13BO14795 1591 aa26.25■■□□□ 1.79
PLGRKT-201ENST00000223864 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.25■■□□□ 1.79
PLGRKT-201ENST00000223864 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.25■■□□□ 1.79
PLGRKT-201ENST00000223864 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.24■■□□□ 1.79
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.23■■□□□ 1.79
PLGRKT-201ENST00000223864 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PLGRKT-201ENST00000223864 TET3O43151 1660 aa26.22■■□□□ 1.79
PLGRKT-201ENST00000223864 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms