RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.31■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.31■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 ATP10AO60312 1499 aa24.29■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 KDM5CP41229 1560 aa24.28■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.28■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.28■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.27■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 E9PCH4 1651 aa24.27■■□□□ 1.48
RABGGTA-201ENST00000216840 NEO1Q92859 1461 aa24.26■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.25■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.25■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.24■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.23■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 TET3O43151 1660 aa24.23■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 GLI2P10070 1586 aa24.22■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.22■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.21■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.21■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF3BO15066 747 aa24.2■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.2■■□□□ 1.47
RABGGTA-201ENST00000216840 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
RABGGTA-201ENST00000216840 KANK1Q14678 1352 aa24.19■■□□□ 1.46
RABGGTA-201ENST00000216840 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.19■■□□□ 1.46
RABGGTA-201ENST00000216840 A2MP01023 1474 aa24.18■■□□□ 1.46
RABGGTA-201ENST00000216840 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.18■■□□□ 1.46
RABGGTA-201ENST00000216840 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
RABGGTA-201ENST00000216840 TRPM2O94759 1503 aa24.16■■□□□ 1.46
RABGGTA-201ENST00000216840 USP47Q96K76 1375 aa24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC7Q96M83 1385 aa24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-201ENST00000216840 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-201ENST00000216840 PTPRTO14522 1441 aa24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-201ENST00000216840 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCA6Q8N139 1617 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 RGL3Q3MIN7 710 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 RICTORQ6R327 1708 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 DIP2BQ9P265 1576 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 ANP32CO43423 234 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 CEP152O94986 1710 aa24.11■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 RAPGEF3O95398 923 aa24.1■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 CLTCL1P53675 1640 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-201ENST00000216840 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-201ENST00000216840 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-201ENST00000216840 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-201ENST00000216840 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-201ENST00000216840 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-201ENST00000216840 CCER2I3L3R5 266 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-201ENST00000216840 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-201ENST00000216840 LAMC1P11047 1609 aa24.01■■□□□ 1.43
RABGGTA-201ENST00000216840 TSPOAP1O95153 1857 aa24■■□□□ 1.43
RABGGTA-201ENST00000216840 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24■■□□□ 1.43
RABGGTA-201ENST00000216840 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.98■■□□□ 1.43
RABGGTA-201ENST00000216840 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
RABGGTA-201ENST00000216840 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.96■■□□□ 1.43
RABGGTA-201ENST00000216840 MADDQ8WXG6 1647 aa23.96■■□□□ 1.43
RABGGTA-201ENST00000216840 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 GGT6Q6P531 493 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF1BO60333 1816 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCC3O15438 1527 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 STAC3Q96MF2 364 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 NPATQ14207 1427 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-201ENST00000216840 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-201ENST00000216840 MROH2AA6NES4 1674 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-201ENST00000216840 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGGTA-201ENST00000216840 IFT172Q9UG01 1749 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-201ENST00000216840 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-201ENST00000216840 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.85■■□□□ 1.41
RABGGTA-201ENST00000216840 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
RABGGTA-201ENST00000216840 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.84■■□□□ 1.41
RABGGTA-201ENST00000216840 ADGRB3O60242 1522 aa23.83■■□□□ 1.41
RABGGTA-201ENST00000216840 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.83■■□□□ 1.41
RABGGTA-201ENST00000216840 MYOM2P54296 1465 aa23.83■■□□□ 1.4
RABGGTA-201ENST00000216840 IQGAP1P46940 1657 aa23.83■■□□□ 1.4
RABGGTA-201ENST00000216840 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.82■■□□□ 1.4
RABGGTA-201ENST00000216840 NOS1P29475 1434 aa23.79■■□□□ 1.4
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.79■■□□□ 1.4
RABGGTA-201ENST00000216840 REREQ9P2R6 1566 aa23.78■■□□□ 1.4
RABGGTA-201ENST00000216840 TESK2Q96S53 571 aa23.78■■□□□ 1.4
RABGGTA-201ENST00000216840 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
RABGGTA-201ENST00000216840 PIK3C2BO00750 1634 aa23.76■■□□□ 1.39
RABGGTA-201ENST00000216840 SYNMO15061 1565 aa23.76■■□□□ 1.39
RABGGTA-201ENST00000216840 PPLO60437 1756 aa23.75■■□□□ 1.39
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