RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001700.6

Hoxc13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc13, Length 2,461 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Lekr1B2RVN1 116 aa28,8■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Chic2Q9D9G3 165 aa28,8■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccdc183A2AJB1 534 aa28,79■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Setbp1Q9Z180 1582 aa28,79■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Trim44Q9QXA7 346 aa28,79■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Erbb4Q61527 1308 aa28,78■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Shroom4Q1W617 1475 aa28,78■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zscan21Q07231 555 aa28,77■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP28,77■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 TnnQ80Z71 1560 aa28,77■■■□□ 2,2
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mtus2Q3UHD3 1353 aa28,76■■■□□ 2,19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28,75■■■□□ 2,19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ercc6F8VPZ5 1481 aa28,74■■■□□ 2,19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP28,74■■■□□ 2,19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP28,74■■■□□ 2,19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Sptbn5F6UCX4 1208 aa28,72■■■□□ 2,19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP28,72■■■□□ 2,19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dnajc14Q921R4 703 aa28,71■■■□□ 2,19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 CadpsQ80TJ1 1355 aa28,71■■■□□ 2,19
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ssh1Q76I79 1042 aa28,69■■■□□ 2,18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gys2Q8VCB3 704 aa28,67■■■□□ 2,18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dcaf11Q91VU6 549 aa28,67■■■□□ 2,18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ttc41Q692V3 1318 aa28,67■■■□□ 2,18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 SlkO54988 1233 aa28,67■■■□□ 2,18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gse1Q3U3C9 1213 aa28,66■■■□□ 2,18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pkd2O35245 966 aa28,66■■■□□ 2,18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tshz2Q68FE9 1030 aa28,65■■■□□ 2,18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP28,64■■■□□ 2,18
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Unc13aQ4KUS2 1712 aa28,64■■■□□ 2,17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 VgfQ0VGU4 617 aa28,63■■■□□ 2,17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rwdd1Q9CQK7 243 aa28,63■■■□□ 2,17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Q7TT23 1179 aa28,62■■■□□ 2,17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fbxo2Q80UW2 297 aa28,62■■■□□ 2,17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa28,62■■■□□ 2,17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dapk1Q80YE7 1442 aa28,61■■■□□ 2,17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP28,61■■■□□ 2,17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP28,6■■■□□ 2,17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP28,58■■■□□ 2,17
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mknk2Q8CDB0 459 aa28,57■■■□□ 2,16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cux1P53564 1515 aa28,57■■■□□ 2,16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mug1P28665 1476 aa28,57■■■□□ 2,16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP28,56■■■□□ 2,16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Naip6Q9JIB6 1403 aa28,56■■■□□ 2,16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rundc1Q0VDN7 615 aa28,56■■■□□ 2,16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa28,55■■■□□ 2,16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Apbb1Q9QXJ1 710 aa28,54■■■□□ 2,16
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Catsper2A2ARP9 588 aa28,49■■■□□ 2,15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Plcb2A3KGF7 1181 aa28,49■■■□□ 2,15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rabep1O35551 862 aa28,49■■■□□ 2,15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif16bB1AVY7 1312 aa28,48■■■□□ 2,15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pik3c2gO70167 1506 aa28,47■■■□□ 2,15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mbd5B1AYB6 1498 aa28,46■■■□□ 2,15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Card11Q8CIS0 1159 aa28,46■■■□□ 2,15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tmem132aQ922P8 1018 aa28,45■■■□□ 2,15
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pdcl2Q78Y63 240 aa28,44■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Plekhh1Q80TI1 1356 aa28,43■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gm14025A2AP89 1413 aa28,41■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ush1cQ9ES64 910 aa28,41■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccnb3Q810T2 1396 aa28,4■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 CrbnQ8C7D2 445 aa28,4■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP28,4■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zfp644E9QA22 1323 aa28,4■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kiaa0753Q6A000 959 aa28,4■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tspyl2Q7TQI8 677 aa28,4■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa28,4■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mug2P28666 1451 aa28,39■■■□□ 2,14
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP28,38■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ddit3P35639 168 aa28,38■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif15Q6P9L6 1387 aa28,38■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa28,37■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Esx1O88933 382 aa28,37■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Sox12Q04890 314 aa28,37■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rgl3Q3UYI5 709 aa28,36■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Stac3Q8BZ71 360 aa28,36■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Terf2O35144 541 aa28,35■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Erich6bQ9D4S6 220 aa28,35■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Soga1E1U8D0 1418 aa28,35■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP28,33■■■□□ 2,13
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Lamc3Q9R0B6 1581 aa28,32■■■□□ 2,12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP28,3■■■□□ 2,12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Aebp1Q640N1 1128 aa28,3■■■□□ 2,12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccdc94Q9D6J3 314 aa28,3■■■□□ 2,12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa28,29■■■□□ 2,12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rock1P70335 1354 aa28,28■■■□□ 2,12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rfx7F8VPJ6 1459 aa28,28■■■□□ 2,12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ift140E9PY46 1464 aa28,27■■■□□ 2,12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Becn1O88597 448 aa28,27■■■□□ 2,12
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zhx1P70121 873 aa28,26■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gzf1Q4VBD9 706 aa28,26■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ubl4bQ9CQ84 188 aa28,26■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Plcd3Q8K2J0 785 aa28,25■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP28,24■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP28,23■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fam13bQ8K2H3 851 aa28,23■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rlbp1Q9Z275 317 aa28,23■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif27Q7M6Z4 1394 aa28,23■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fez1Q8K0X8 392 aa28,23■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa28,22■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pnma3Q8JZW8 466 aa28,21■■■□□ 2,11
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Carmil1Q6EDY6 1374 aa28,2■■■□□ 2,1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,8 ms