RNA–Protein interactions for RNA: YNR069C

BSC5, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene BSC5, Length 1,470 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BSC5	YNR069C	MER1	P16523	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	PET123	P17558	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YUR1	P26725	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YEF1	P32622	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	NAT2	P37293	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	GPX2	P38143	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	BZZ1	P38822	633 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	SAD1	P43589	448 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	CAF40	P53829	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	SET6	Q12529	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RPC37	P36121	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YHK8	P38776	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	MTC6	P38849	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	PEX18	P38855	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	ATG7	P38862	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	DSE1	P40077	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RPR2	P40571	144 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YDL186W	P48568	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	HXT11	P54862	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	UTR1	P21373	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	MRPL8	P22353	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	MRPL25	P23369	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	MRPS5	P33759	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	IML3	P38265	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YBR137W	P38276	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YND1	P40009	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	NCA3	P46955	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	ABM1	P47146	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	GTO1	P48239	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RAD17	P48581	401 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YNL050C	P53952	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	GAT3	Q07928	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YRM1	Q12340	786 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	UNG1	P12887	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	TIR2	P33890	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	HER2	Q03557	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	ERV41	Q04651	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RAX1	Q08760	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	HXT1	P32465	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YMR262W	P38430	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	AGX1	P43567	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	DAP1	Q12091	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
BSC5	YNR069C	ATR1	P13090	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	CSM1	P25651	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	SPR1	P32603	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	COT1	P32798	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	VAM7	P32912	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	HSM3	P38348	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RPH1	P39956	796 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YMR134W	P40207	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YJR030C	P47101	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	NAS6	P50086	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YGR266W	P53326	701 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RAD1	P06777	1100 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RAD7	P06779	565 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	MRP4	P32902	394 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	ECT1	P33412	323 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	RPC25	P35718	212 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YHR182W	P38870	785 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	JLP2	P40206	208 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	YFL067W	P43537	175 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	LST7	P53237	242 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BSC5	YNR069C	APC4	Q04601	652 aa		4.9	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.6 ms