RNA–Protein interactions for RNA: YNL298W

CLA4, Transcript of Cdc42p-activated signal transducing kinase, yeast

Gene CLA4, Length 2,529 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLA4	YNL298W	ZRC1	P20107	442 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	ADE1	P27616	306 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YKL097C	P34245	136 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	LDB7	P38210	180 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SUL1	P38359	859 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	GLG2	P47011	380 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	MRM2	P53123	320 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	HSP31	Q04432	237 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	COQ11	Q05892	277 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SUE1	Q06524	206 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	PAM18	Q07914	168 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	ENB1	Q08299	606 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SNL1	P40548	159 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	HIT1	P46973	164 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	ARR2	Q06597	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	FLO11	P08640	1367 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SUC2	P00724	532 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	CSM1	P25651	190 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	PPZ1	P26570	692 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	PEX3	P28795	441 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	CSE1	P33307	960 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	MIA40	P36046	403 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YKL071W	P36086	256 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	ETR1	P38071	380 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	FMP32	P43557	207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	BNA7	Q04066	261 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	BUR2	Q05949	395 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	TDA6	Q06466	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	ASA1	Q06822	443 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YET3	Q07451	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	LST4	P34239	828 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SAD1	P43589	448 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	STB4	P50104	949 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	AAD15	Q08361	143 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	NUP1	P20676	1076 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	MXR2	P25566	168 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	TFC1	P32367	649 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	TOA2	P32774	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SPT10	P35208	640 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	PFS1	P38872	237 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	PMT6	P42934	759 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
CLA4	YNL298W	SPT20	P50875	604 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	MRP51	Q02950	344 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SMP3	Q04174	516 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	PRM6	Q04705	352 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	FMP42	Q04991	504 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	DOA1	P36037	715 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	RIB1	P38066	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YFL015C	P43578	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YJR154W	P47181	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SNO2	P53823	222 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	ARK1	P53974	638 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	PFA5	Q03289	374 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YET2	Q04210	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	GLE1	Q12315	538 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	MET3	P08536	511 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	GCN3	P14741	305 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	NDT80	P38830	627 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	MTQ1	P53944	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	GPI17	Q04080	534 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	IVY1	Q04934	453 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	RTT103	Q05543	409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	WHI2	P12611	486 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLA4	YNL298W	UTR1	P21373	530 aa		4.73	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.6 ms