RNA–Protein interactions for RNA: YGR279C

SCW4, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeast

Gene SCW4, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW4	YGR279C	MLH1	P38920	769 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PZF1	P39933	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	DDI1	P40087	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	LAS21	P40367	830 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YRB2	P40517	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	HMS2	P47175	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	COS10	P52924	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MNT4	P53745	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YNL181W	P53878	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	VPS36	Q06696	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CRT10	Q08226	957 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PNS1	Q12412	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RPB10	P22139	70 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ERG8	P24521	451 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PTP2	P29461	750 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SUR1	P33300	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	JEN1	P36035	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YKL071W	P36086	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	BAP2	P38084	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	IPT1	P38954	527 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
SCW4	YGR279C	YJL193W	P39542	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RRG9	P40156	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	HXT9	P40885	567 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MEP3	P53390	489 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SUR7	P54003	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	HXT11	P54862	567 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	HOT1	Q03213	719 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TLG1	Q03322	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	GRX3	Q03835	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ARP10	Q04549	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	HDA2	Q06629	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ENB1	Q08299	606 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MET32	Q12041	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TIM9	O74700	87 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CYT1	P07143	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	OAC1	P32332	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TIM12	P32830	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TPO5	P36029	618 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	CHK1	P38147	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SRO77	P38163	1010 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	TAT2	P38967	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RET2	P43621	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SRL4	Q03085	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YMD8	Q03697	442 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RCF1	Q03713	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	SMP3	Q04174	516 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	ARV1	Q06541	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	REH1	Q06709	432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	COQ10	Q08058	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	NTG2	Q08214	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RDR1	Q08904	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	UIP4	Q08926	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	RLM1	Q12224	676 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	DFG16	Q99234	619 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCW4	YGR279C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW4	YGR279C	SNF6	P18888	332 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW4	YGR279C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCW4	YGR279C	PRP28	P23394	588 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW4	YGR279C	EMP70	P32802	667 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCW4	YGR279C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.4 ms