RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CASD1Q96PB1 797 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CEP89Q96ST8 783 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAP7D2Q96T17 732 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RIT2Q99578 217 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AAASQ9NRG9 546 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RNF19AQ9NV58 838 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.67□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARID2Q68CP9 1835 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CPLX1O14810 134 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC37A4O43826 429 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LAG3P18627 525 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CYP3A7P24462 503 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMOD1P28289 359 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UBE3AQ05086 875 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SCRN1Q12765 414 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 COASYQ13057 564 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 INF2Q27J81 1249 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RNF135Q8IUD6 432 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RNF169Q8NCN4 708 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NLRP7Q8WX94 980 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MBOAT7Q96N66 472 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TLE6Q9H808 572 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TLR9Q9NR96 1032 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C5orf42Q9H799 3197 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A087WZ62 844 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A0U1RQF3 1178 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HIDE1A8MVS5 230 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EML1O00423 815 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FSCN2O14926 492 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HOXA2O43364 376 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLCB3Q01970 1234 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KCNC3Q14003 757 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DUSP6Q16828 381 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LETM2Q2VYF4 491 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 XKR3Q5GH77 459 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANO5Q75V66 913 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KSR1Q8IVT5 923 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ABI1Q8IZP0 508 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LRRC43Q8N309 656 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RDM1Q8NG50 284 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HELQQ8TDG4 1101 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF558Q96NG5 402 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SCLT1Q96NL6 688 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TCF25Q9BQ70 676 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.64□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.64□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.64□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CTDNEP1O95476 244 aa6.64□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EOMESO95936 686 aa6.64□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TECP42680 631 aa6.64□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DNM2P50570 870 aa6.64□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NPEPPSP55786 919 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms