RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636839.1

CLN3-250, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 2,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-250ENST00000636839 PPFIA4O75335 1185 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 ELNP15502 786 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 TLK2Q86UE8 772 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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CLN3-250ENST00000636839 NR1I3Q14994 352 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 FAM167AQ96KS9 214 aa22.15■■□□□ 1.14
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CLN3-250ENST00000636839 TSG101Q99816 390 aa22.15■■□□□ 1.14
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CLN3-250ENST00000636839 A0A1B0GTH6 734 aa22.14■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.14■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 BEX3Q00994 111 aa22.14■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.14■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 KIFAP3Q92845 792 aa22.14■■□□□ 1.14
CLN3-250ENST00000636839 GPR25O00155 361 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 KIF20AO95235 890 aa22.14■■□□□ 1.13
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CLN3-250ENST00000636839 CHMP4BP1P59074 171 aa22.14■■□□□ 1.13
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CLN3-250ENST00000636839 KIF22Q14807 665 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 H3BRB1 525 aa22.13■■□□□ 1.13
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CLN3-250ENST00000636839 GJB1P08034 283 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 INSRRP14616 1297 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 GLRA2P23416 452 aa22.13■■□□□ 1.13
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CLN3-250ENST00000636839 ARL2P36404 184 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 NCKAP1LP55160 1127 aa22.13■■□□□ 1.13
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CLN3-250ENST00000636839 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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CLN3-250ENST00000636839 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.13■■□□□ 1.13
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CLN3-250ENST00000636839 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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CLN3-250ENST00000636839 DENND3A2RUS2 1198 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 CASP4P49662 377 aa22.11■■□□□ 1.13
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CLN3-250ENST00000636839 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.11■■□□□ 1.13
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CLN3-250ENST00000636839 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 SMTNP53814 917 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 IRF5Q13568 498 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CLN3-250ENST00000636839 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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