RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMM50Q9Y512 469 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA8AA7E2F4 631 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA8BA8MQT2 603 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEB2O15479 319 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TMOD1P28289 359 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 NUBP1P53384 320 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 EFCAB12Q6NXP0 572 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC71Q8N4P6 559 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TCEANC2Q96MN5 208 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAM7Q9H2U9 754 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 SETQ01105 290 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ITIH3Q06033 890 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 BRD1O95696 1058 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 WEE2P0C1S8 567 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 MTHFRP42898 656 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.554e-11■□□□□ 10.1
CAPNS1-217ENST00000629983 FUT2Q10981 343 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 NECTIN1Q15223 517 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A11Q8N1S5 342 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 HELQQ8TDG4 1101 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM167AQ96KS9 214 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA1HO95180 2353 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf71A6NGG8 1288 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 CLLU1OSQ5K130 101 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF20Q5VTR2 975 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD1Q9H3U5 465 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 BRPF3Q9ULD4 1205 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP3A4P08684 503 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM169Q96HH4 297 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS10Q9H324 1103 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCL14O95715 111 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 FGFR4P22455 802 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR16Q569H4 304 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP7Q8WX94 980 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 SMOC2Q9H3U7 446 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ASGR2P07307 311 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM105Q8N8V8 129 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 USP34Q70CQ2 3546 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 OATP04181 439 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 BCAR1P56945 870 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF710Q8N1W2 664 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf50Q9HD87 102 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 NRBP2Q9NSY0 501 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 DZANK1Q9NVP4 752 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0U1RQF3 1178 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR64B1ANS9 1081 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 DARSP14868 501 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 GPC3P51654 580 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ASCL5Q7RTU5 278 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS52Q8N1B4 723 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01465Q8N7H1 131 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 AUTS2Q8WXX7 1259 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 DACT1Q9NYF0 836 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 LIMD1Q9UGP4 676 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 SPDYE4A6NLX3 237 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 EOMESO95936 686 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC27P30260 824 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKCEQ02156 737 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ATAT1Q5SQI0 421 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 MCTP2Q6DN12 878 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYGNQ8WXF5 182 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 PROB1E7EW31 1015 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 FGD1P98174 961 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1841Q6NSI8 718 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 KANK3Q6NY19 840 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 EVPLQ92817 2033 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 CHMP2AO43633 222 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 DISC1Q9NRI5 854 aa30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms