RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NLRP4Q96MN2 994 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP25Q9UHP3 1055 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPME1Q9Y570 386 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MBD3O95983 291 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AMPD3Q01432 767 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTK7Q13308 1070 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SNX17Q15036 470 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NFKBIBQ15653 356 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SERINC5Q86VE9 423 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCTD17Q8N5Z5 321 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ASAP3Q8TDY4 903 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TCP11Q8WWU5 503 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD4P01730 458 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLTBP09497 229 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAAP100Q0VG06 881 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POSTNQ15063 836 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIZQ2M2Z5 673 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAF2Q6P1X5 1199 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RSPH3Q86UC2 560 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NLRP7Q8WX94 980 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BSNDQ8WZ55 320 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DRC1Q96MC2 740 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM9Q9C026 710 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D7Q9P0N9 293 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC169A6NNP5 214 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 M0QZ92 97 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GAS2O43903 313 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GUCY2CP25092 1073 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PEX3P56589 373 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAPK7Q13164 816 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GIT2Q14161 759 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IER5Q5VY09 327 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SFR1Q86XK3 245 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EXOC8Q8IYI6 725 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DAW1Q8N136 415 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYCT1Q8N699 235 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC155Q8N6L0 562 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LINC01465Q8N7H1 131 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DPF3Q92784 378 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IFT74Q96LB3 600 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OSMRQ99650 979 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NUP62CLQ9H1M0 184 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HIPK3Q9H422 1215 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDLIM7Q9NR12 457 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PANK4Q9NVE7 773 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCN5AQ14524 2016 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTMSP20962 102 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GLRA2P23416 452 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCL23P55773 120 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAPSQ13938 189 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C1orf53Q5VUE5 145 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KANK3Q6NY19 840 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF149Q8NC42 400 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIFAP3Q92845 792 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HPS3Q969F9 1004 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLSTN2Q9H4D0 955 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EXOC1Q9NV70 894 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCND2Q9NZV8 630 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ODF2LQ9ULJ1 636 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A087WZ62 844 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 K7ENM7 598 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EVI5O60447 810 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CKBP12277 381 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYN1P17600 705 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms