RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 COG2Q14746 738 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PANX2Q96RD6 677 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PDIK1LQ8N165 341 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 OXER1Q8TDS5 423 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ADGRB3O60242 1522 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 IFNAR2P48551 515 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 DR1Q01658 176 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 MUM1Q2TAK8 710 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PASD1Q8IV76 773 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 FAF2Q96CS3 445 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 KLC2Q9H0B6 622 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 POTEFA5A3E0 1075 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 M0QYV0 167 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 NEMP1O14524 444 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 POTEIP0CG38 1075 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 SNAPC2Q13487 334 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 POTEGQ6S5H5 508 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 KYAT1Q16773 422 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TTC39CQ8N584 583 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 VPS39Q96JC1 886 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 CEP72Q9P209 647 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 CPB1P15086 417 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 USP11P51784 963 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 KCTD16Q68DU8 428 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 IFT43Q96FT9 208 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF26B4DH59 902 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 SUN1O94901 812 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 NBPF15Q8N660 670 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 VAMP7P51809 220 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 CENPUQ71F23 418 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
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CTDP1-208ENST00000613122 SERPINB6P35237 376 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 IL1RL1Q01638 556 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 CYP27A1Q02318 531 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
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CTDP1-208ENST00000613122 CLTCL1P53675 1640 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 C19orf81C9J6K1 198 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 RCN2Q14257 317 aa21.6■■□□□ 1.05
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CTDP1-208ENST00000613122 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 CHEK2O96017 543 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 VEPH1Q14D04 833 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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CTDP1-208ENST00000613122 Q9H521 79 aa21.6■■□□□ 1.05
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CTDP1-208ENST00000613122 EVI5O60447 810 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 SMIM5Q71RC9 77 aa21.6■■□□□ 1.05
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CTDP1-208ENST00000613122 KIF3CO14782 793 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 CDC26Q8NHZ8 85 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ACAP3Q96P50 834 aa21.6■■□□□ 1.05
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CTDP1-208ENST00000613122 GINM1Q9NU53 330 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 USP31Q70CQ4 1352 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 C12orf60Q5U649 245 aa21.59■■□□□ 1.05
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CTDP1-208ENST00000613122 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 SDC4P31431 198 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF560Q96MR9 790 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 POLD4Q9HCU8 107 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 BCAS4Q8TDM0 211 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 LPAR1Q92633 364 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 KIF12Q96FN5 646 aa21.59■■□□□ 1.05
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