RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 GH1P01241 217 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 NR3C1P04150 777 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 NR2F2P24468 414 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN21Q16825 1174 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 COPS5Q92905 334 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ACCSQ96QU6 501 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 DMAC2Q9NW81 257 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 PYCARDQ9ULZ3 195 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 CA12O43570 354 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SCP2P22307 547 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 MTERF2Q49AM1 385 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 C12orf56Q8IXR9 622 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 GBP3Q9H0R5 595 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCD1P33897 745 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 NPTX2P47972 431 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SMTNP53814 917 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 PEX3P56589 373 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 EMC2Q15006 297 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 IQSEC1Q6DN90 963 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 TC2NQ8N9U0 490 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP8B4Q8TF62 1192 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 NDST4Q9H3R1 872 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHA2P01877 340 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 CRHR2Q13324 411 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ACVR2BQ13705 512 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM63BQ5T3F8 832 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOC8Q8IYI6 725 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 PPTC7Q8NI37 304 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 BSNDQ8WZ55 320 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 H0YCG3 227 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 MAFO75444 373 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ALDH1A1P00352 501 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SKILP12757 684 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 ARL2P36404 184 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNJ6P48051 423 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 RBL2Q08999 1139 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 OLFML2BQ68BL8 750 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 KSR1Q8IVT5 923 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 RETREG2Q8NC44 543 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 IQCDQ96DY2 449 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC51Q96ER9 411 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 PANX2Q96RD6 677 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 NUP58Q9BVL2 599 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 GJD2Q9UKL4 321 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC16A4O15374 487 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 NRDCO43847 1150 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 GYPCP04921 128 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ADCYAP1R1P41586 468 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 PLCB4Q15147 1175 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 FIGNQ5HY92 759 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP135Q66GS9 1140 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 GLG1Q92896 1179 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 BORCS6Q96GS4 357 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 IFT74Q96LB3 600 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 ZIC5Q96T25 663 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 KMT5AQ9NQR1 393 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOC7Q9UPT5 735 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 GAS2O43903 313 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 MFAP3LO75121 409 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 AKAP3O75969 853 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 TPM1P09493 284 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 FECHP22830 423 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 RGS2P41220 211 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 CNGA4Q8IV77 575 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP4K3Q8IVH8 894 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SYCP3Q8IZU3 236 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC7A3Q8WY07 619 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-207ENST00000589146 KCND1Q9NSA2 647 aa25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms