RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-208ENST00000589104 EP400Q96L91 3159 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PLSCR1O15162 318 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 MSH4O15457 936 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 MGRN1O60291 552 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 KCNQ4P56696 695 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 TNNC1P63316 161 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 GPBP1Q86WP2 473 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.61□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PLA2G6O60733 806 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 GALNTL6Q49A17 601 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 COL4A5P29400 1685 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 GNPATO15228 680 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 EPC2Q52LR7 807 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 POTEFA5A3E0 1075 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 TRAF5O00463 557 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 NR3C1P04150 777 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 POTEIP0CG38 1075 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SOX5P35711 763 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CASP4P49662 377 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 JAG1P78504 1218 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 POTEGQ6S5H5 508 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.6□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 EML1O00423 815 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 TCEA3O75764 348 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 NR2F2P24468 414 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CBLBQ13191 982 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SFR1Q86XK3 245 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 RELL1Q8IUW5 271 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 DAW1Q8N136 415 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 RFFLQ8WZ73 363 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 WDR18Q9BV38 432 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 GGA1Q9UJY5 639 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 STAT3P40763 770 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ARHGAP4P98171 946 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CFAP58Q5T655 872 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CCDC17Q96LX7 622 aa14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 ASAP2O43150 1006 aa14.58□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 GRIN3BO60391 1043 aa14.58□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SLITRK3O94933 977 aa14.58□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 KCNA1Q09470 495 aa14.58□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 MTMR3Q13615 1198 aa14.58□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.58□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.58□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.58□□□□□ -0.07
KDM4B-208ENST00000589104 FAM187AA6NFU0 413 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 FERP16591 822 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 GAP43P17677 238 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 RPS6KA1Q15418 735 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 ALG3Q92685 438 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 MCM8Q9UJA3 840 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 CCDC189A1A4V9 331 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 PPP2R2AP63151 447 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 CBWD6Q4V339 395 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 RAPGEF5Q92565 580 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 ART4Q93070 314 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.58□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 NFASCO94856 1347 aa14.57□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 GMNCA6NCL1 334 aa14.57□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.57□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 H0YHG0 523 aa14.57□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 CETN3O15182 167 aa14.57□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 RSPH10BP0C881 870 aa14.57□□□□□ -0.08
KDM4B-208ENST00000589104 CHRNB2P17787 502 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms