RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 RNF19AQ9NV58 838 aa20.58■□□□□ 0.89
CTIF-206ENST00000588345 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CTIF-206ENST00000588345 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.58■□□□□ 0.89
CTIF-206ENST00000588345 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 LINC01565O15544 149 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 MBTPS2O43462 519 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 PFKFB2O60825 505 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 CSPG5O95196 566 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 FGFR1P11362 822 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ANAPC15P60006 121 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 EFHBQ8N7U6 833 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 IGFLR1Q9H665 355 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 HCSTQ9UBK5 93 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 HOXA2O43364 376 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 SLC37A4O43826 429 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 CDC42EP1Q00587 391 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 DRP2Q13474 957 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 FGF18O76093 207 aa20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 XBP1P17861 261 aa20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 LAG3P18627 525 aa20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 PPP2R5CQ13362 524 aa20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 LETM2Q2VYF4 491 aa20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 MTERF2Q49AM1 385 aa20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 NEK8Q86SG6 692 aa20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 CASD1Q96PB1 797 aa20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 TLR9Q9NR96 1032 aa20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 CD207Q9UJ71 328 aa20.55■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 A0A0U1RQF3 1178 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 TMEM150BA6NC51 233 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 CTDNEP1O95476 244 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 EYA4O95677 639 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ALADP13716 330 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 NRIP1P48552 1158 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 PSMC5P62195 406 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 PLCB3Q01970 1234 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 CLUL1Q15846 466 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 NLRP7Q8WX94 980 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 FAM20AQ96MK3 541 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 CLEC1BQ9P126 229 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 VAV3Q9UKW4 847 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 LZTS1Q9Y250 596 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 EML1O00423 815 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 FSCN2O14926 492 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 TBX3O15119 743 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 GLP2RO95838 553 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 NDUFV1P49821 464 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 AK2P54819 239 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD1Q15327 319 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ANO5Q75V66 913 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ZNF410Q86VK4 478 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 LRRC43Q8N309 656 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 SCLT1Q96NL6 688 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 CHST12Q9NRB3 414 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 DACT1Q9NYF0 836 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 EOMESO95936 686 aa20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 FGFR4P22455 802 aa20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 DNM2P50570 870 aa20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 ERVFC1P60507 584 aa20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 COASYQ13057 564 aa20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 OXER1Q8TDS5 423 aa20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.52■□□□□ 0.88
CTIF-206ENST00000588345 A0A087WZ62 844 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-206ENST00000588345 FSD2A1L4K1 749 aa20.51■□□□□ 0.87
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