RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 EXT2Q93063 718 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF394Q53GI3 561 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PCYT1AP49585 367 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 CPVLQ9H3G5 476 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 GYG2O15488 501 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV5-2P06315 115 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 OCRLQ01968 901 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 H0Y3Z8 333 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf87Q6PH81 154 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM15Q9C019 465 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM260Q9NX78 707 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PMLP29590 882 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TEX33O43247 280 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 RNF139Q8WU17 664 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 CHEK2O96017 543 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 COA1Q9GZY4 146 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PPP2R2AP63151 447 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 KIF19Q2TAC6 998 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 NUP85Q9BW27 656 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ANXA13P27216 316 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 CAV1Q03135 178 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 EPC1Q9H2F5 836 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 WDR64B1ANS9 1081 aa22.8■■□□□ 1.24
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.8■■□□□ 1.24
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PTPRM-211ENST00000580170 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 KRT39Q6A163 491 aa22.79■■□□□ 1.24
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PTPRM-211ENST00000580170 ESYT3A0FGR9 886 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 GH2P01242 217 aa22.79■■□□□ 1.24
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PTPRM-211ENST00000580170 MTMR1Q13613 665 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PADI6Q6TGC4 694 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TXNRD1Q16881 649 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 GMNCA6NCL1 334 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 KITP10721 976 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 NR1H3Q13133 447 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 POTEB3A0JP26 581 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 POTECB2RU33 542 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L15C9J2P7 530 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L11C9JVI0 530 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L18D6R9N7 530 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L22D6RA61 530 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L19D6RCP7 530 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L20D6RJB6 530 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 MAN1A2O60476 641 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 EPHB1P54762 984 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L24Q0WX57 530 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 POTEBQ6S5H4 581 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 CDC26Q8NHZ8 85 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 CEP19Q96LK0 163 aa22.78■■□□□ 1.24
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