RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 TSHZ3Q63HK5 1081 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 TTLL5Q6EMB2 1281 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 CPNE8Q86YQ8 564 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 FAM126BQ8IXS8 530 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 IFNL3Q8IZI9 196 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 MYOCDQ8IZQ8 938 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 CPXCR1Q8N123 301 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL36Q8N4N3 616 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 Q8TCH9 128 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHO2Q8TD55 490 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 SEC14L1Q92503 715 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 E2F7Q96AV8 911 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 GBP4Q96PP9 640 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 GMLQ99445 158 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 MCMBPQ9BTE3 642 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF700Q9H0M5 742 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 HOMER2Q9NSB8 354 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 GINM1Q9NU53 330 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 WHRNQ9P202 907 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 PCSK1NQ9UHG2 260 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 ZNRF3Q9ULT6 936 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 BACE2Q9Y5Z0 518 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC66A2RUB6 948 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 SMTNL1A8MU46 457 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 C19orf81C9J6K1 198 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 PRRT4C9JH25 899 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 H0Y3Z8 333 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 STXBP3O00186 592 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRM-204ENST00000577468 IDEP14735 1019 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 IL4RP24394 825 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRM-204ENST00000577468 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 PPP2R5BQ15173 497 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 ZSCAN26Q16670 478 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRM-204ENST00000577468 SKA1Q96BD8 255 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 PGBD4Q96DM1 585 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRM-204ENST00000577468 MKS1Q9NXB0 559 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRM-204ENST00000577468 ENPP1P22413 925 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRM-204ENST00000577468 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 UNC5AQ6ZN44 842 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 RNF207Q6ZRF8 634 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 MCM10Q7L590 875 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 TRIML1Q8N9V2 468 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 FAM184AQ8NB25 1140 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM87AQ8NBN3 555 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRM-204ENST00000577468 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
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