RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 KCNT2Q6UVM3 1135 aa28.9■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 VN1R2Q8NFZ6 395 aa28.9■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 CASD1Q96PB1 797 aa28.9■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 SLC26A6Q9BXS9 759 aa28.9■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 GAS7O60861 476 aa28.89■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 TECP42680 631 aa28.89■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 ZXDAP98168 799 aa28.89■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 PRKCEQ02156 737 aa28.89■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.89■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 ADAMTS10Q9H324 1103 aa28.89■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
E2F4-213ENST00000569573 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa28.88■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 LLGL2Q6P1M3 1020 aa28.88■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 TMC7Q7Z402 723 aa28.88■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa28.88■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 ECHDC2Q86YB7 292 aa28.88■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 NLRP7Q8WX94 980 aa28.88■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 TEKT3Q9BXF9 490 aa28.88■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 PIEZO1Q92508 2521 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 SFNP31947 248 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 JAK3P52333 1124 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 LRCH2Q5VUJ6 765 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 ANKRD54Q6NXT1 300 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 LENG9Q96B70 501 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 RIT2Q99578 217 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 SPG21Q9NZD8 308 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 NID2Q14112 1375 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 MSH4O15457 936 aa28.86■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 CA8P35219 290 aa28.86■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 PBX3P40426 434 aa28.86■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 GPC3P51654 580 aa28.86■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 NLRP5P59047 1200 aa28.86■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 LRRC55Q6ZSA7 311 aa28.86■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 LINC01465Q8N7H1 131 aa28.86■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 SUSD6Q92537 303 aa28.86■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 APOL5Q9BWW9 433 aa28.86■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 DACT1Q9NYF0 836 aa28.86■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 TECTAO75443 2155 aa28.86■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 ZNF862O60290 1169 aa28.85■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 DARSP14868 501 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 RPS6KB1P23443 525 aa28.85■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 PSMA5P28066 241 aa28.85■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 USP11P51784 963 aa28.85■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa28.85■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 ZBTB33Q86T24 672 aa28.85■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 RNF19AQ9NV58 838 aa28.85■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 HIDE1A8MVS5 230 aa28.84■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 HSPA4P34932 840 aa28.84■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 KCNB2Q92953 911 aa28.84■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 EOMESO95936 686 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 IFNAR1P17181 557 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 FGFR4P22455 802 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 CCT2P78371 535 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 SIGLEC14Q08ET2 396 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 UGCGQ16739 394 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 MIER3Q7Z3K6 550 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 HELQQ8TDG4 1101 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 CASP10Q92851 521 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 SLC5A5Q92911 643 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 PRRX2Q99811 253 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 UNC45AQ9H3U1 944 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 ZNF318Q5VUA4 2279 aa28.83■■■□□ 2.21
E2F4-213ENST00000569573 A0A0U1RQF3 1178 aa28.82■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 DNM2P50570 870 aa28.82■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 CDC42EP1Q00587 391 aa28.82■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 NTRK3Q16288 839 aa28.82■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 MTERF2Q49AM1 385 aa28.82■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 TPRNQ4KMQ1 711 aa28.82■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 CLLU1OSQ5K130 101 aa28.82■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 FBXL16Q8N461 479 aa28.82■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 TMEM87AQ8NBN3 555 aa28.82■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 S1PR5Q9H228 398 aa28.82■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 SP100P23497 879 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 PTPN5P54829 565 aa28.81■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 KCNC3Q14003 757 aa28.81■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 FBXL6Q8N531 539 aa28.81■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 RDM1Q8NG50 284 aa28.81■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 TBCKQ8TEA7 893 aa28.81■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.81■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 CES5AQ6NT32 575 aa28.8■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 SYCE2Q6PIF2 218 aa28.8■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 GJA10Q969M2 543 aa28.8■■■□□ 2.2
E2F4-213ENST00000569573 TMEM169Q96HH4 297 aa28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms