RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 AAASQ9NRG9 546 aa23.54■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 EML1O00423 815 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 STBD1O95210 358 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 LARGE1O95461 756 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 FGFR4P22455 802 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 DNAJB1P25685 340 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 DNM2P50570 870 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 PSMC5P62195 406 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 FAM189BP81408 668 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 DRP2Q13474 957 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 CAMK1Q14012 370 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 ME3Q16798 604 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 FAM20AQ96MK3 541 aa23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 KRT2P35908 639 aa23.52■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 NEK4P51957 841 aa23.52■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 PPP2R5CQ13362 524 aa23.52■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.52■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 RNF169Q8NCN4 708 aa23.52■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.52■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.52■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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PPP4C-211ENST00000567642 VAV3Q9UKW4 847 aa23.52■■□□□ 1.36
PPP4C-211ENST00000567642 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 FOSBP53539 338 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 COL19A1Q14993 1142 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 CLUL1Q15846 466 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 GTF3C6Q969F1 213 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 CEP89Q96ST8 783 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 FAM50BQ9Y247 325 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 ARID2Q68CP9 1835 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 FAM205CA6NFA0 338 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 HOXA2O43364 376 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 COL9A1P20849 921 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 IRS1P35568 1242 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 LTBRP36941 435 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 CDC42EP1Q00587 391 aa23.5■■□□□ 1.35
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PPP4C-211ENST00000567642 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 POTEDQ86YR6 584 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.5■■□□□ 1.35
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PPP4C-211ENST00000567642 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 CD320Q9NPF0 282 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 A0A087WZ62 844 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 TBX3O15119 743 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 LINC01565O15544 149 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 GJD3Q8N144 294 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 HAS1Q92839 578 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 FGF18O76093 207 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 SEC24BO95487 1268 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 LAG3P18627 525 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 NDUFV1P49821 464 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 NPEPPSP55786 919 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM29Q14134 588 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 CASD1Q96PB1 797 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 CWH43Q9H720 699 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 DACT1Q9NYF0 836 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 JAK2O60674 1132 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 NRIP1P48552 1158 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 UBE3AQ05086 875 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-211ENST00000567642 ADAM15Q13444 863 aa23.47■■□□□ 1.35
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