RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 TMX1Q9H3N1 280 aa24.12■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.12■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.12■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 DGAT1O75907 488 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 GJB5O95377 273 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 CDC25AP30304 524 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 FAM228AQ86W67 206 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 TCP11Q8WWU5 503 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 TOP1MTQ969P6 601 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 SCLT1Q96NL6 688 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 MTRQ99707 1265 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 CLIC4Q9Y696 253 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 PTPRSQ13332 1948 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 TLL1O43897 1013 aa24.1■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 ZNF410Q86VK4 478 aa24.1■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 KSR1Q8IVT5 923 aa24.1■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.1■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.1■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.1■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.1■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 ARID2Q68CP9 1835 aa24.1■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 A0A087WZ62 844 aa24.09■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 PTPAQ15257 358 aa24.09■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 FAM117BQ6P1L5 589 aa24.09■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 RAD9AQ99638 391 aa24.09■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 GBF1Q92538 1859 aa24.09■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 ASAP2O43150 1006 aa24.08■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.08■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 AK8Q96MA6 479 aa24.08■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 NLRP4Q96MN2 994 aa24.08■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 FAM161BQ96MY7 647 aa24.08■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 ZNF576Q9H609 170 aa24.08■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.08■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.08■■□□□ 1.45
NME3-210ENST00000567271 MGEA5O60502 916 aa24.07■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 CA3P07451 260 aa24.07■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 ARL2P36404 184 aa24.07■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 USP28Q96RU2 1077 aa24.07■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.07■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.06■■□□□ 1.44
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NME3-210ENST00000567271 UPP2O95045 317 aa24.06■■□□□ 1.44
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NME3-210ENST00000567271 GRIN1Q05586 938 aa24.06■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 HYIQ5T013 277 aa24.06■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 PADI6Q6TGC4 694 aa24.06■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 RGS18Q9NS28 235 aa24.06■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 DNM3Q9UQ16 869 aa24.06■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 INSL6Q9Y581 213 aa24.06■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.06■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 CDH23Q9H251 3354 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 LCHNA4D1U4 455 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 E9PMD0 336 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 FGFR4P22455 802 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 PKP1Q13835 747 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 DSC3Q14574 896 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
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NME3-210ENST00000567271 CRIPAKQ8N1N5 446 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 PNMA5Q96PV4 448 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 ADAM2Q99965 735 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 DENND3A2RUS2 1198 aa24.04■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 EYA4O95677 639 aa24.04■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 F13A1P00488 732 aa24.04■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 CYP11B2P19099 503 aa24.04■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 BECN1Q14457 450 aa24.04■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.04■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 RNF149Q8NC42 400 aa24.04■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.04■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 GUCD1Q96NT3 240 aa24.04■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 TTC3P53804 2025 aa24.03■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 SLC26A4O43511 780 aa24.03■■□□□ 1.44
NME3-210ENST00000567271 ARHGEF15O94989 841 aa24.03■■□□□ 1.44
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