RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 CALML4Q96GE6 196 aa23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 EYA4O95677 639 aa23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 HERVK_113Q902F9 699 aa23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACTN1P12814 892 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCP11Q8WWU5 503 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 NLRP7Q8WX94 980 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEPT8Q92599 483 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCLT1Q96NL6 688 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 LAMA3Q16787 3333 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1W2PPC1 479 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBBXA8MT70 800 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC26A4O43511 780 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD52P31358 61 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT85P78386 507 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC15Q8TF66 581 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 NLRP4Q96MN2 994 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLCG1P19174 1290 aa23.29■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 ME1P48163 572 aa23.29■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.29■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 RASIP1Q5U651 963 aa23.29■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 SQORQ9Y6N5 450 aa23.29■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A087WZ62 844 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 CUTAO60888 179 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP11B2P19099 503 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 IKBKEQ14164 716 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP38Q8NB14 1042 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLD4Q9HCU8 107 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 PADI3Q9ULW8 664 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.28■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPS6KA5O75582 802 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARL2P36404 184 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 TXLNAP40222 546 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDC42EP1Q00587 391 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAK2Q13177 524 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA32Q96LK8 384 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 PANK2Q9BZ23 570 aa23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CCNDBP1-208ENST00000566515 BAIAP3O94812 1187 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLA2G4BP0C869 781 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 APBB2Q92870 758 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC12A3P55017 1021 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHC4Q6S5L8 630 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF410Q86VK4 478 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM228AQ86W67 206 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPRSQ13332 1948 aa23.26■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASAP2O43150 1006 aa23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGFR4P22455 802 aa23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLRA2P23416 452 aa23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CCNDBP1-208ENST00000566515 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms