RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ASB14	A6NK59	587 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ARIH2	O95376	493 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CCL5	P13501	91 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	HOXD13	P35453	343 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ZBED6	P86452	979 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MEA1	Q16626	185 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	WDR59	Q6PJI9	974 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TNS4	Q8IZW8	715 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RNF208	Q9H0X6	261 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ZBTB39	O15060	712 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MYB	P10242	640 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	GNG11	P61952	73 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	COPS5	Q92905	334 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ARMC5	Q96C12	935 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	JADE2	Q9NQC1	790 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MYH11	P35749	1972 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	EPHB6	O15197	1021 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	GAP43	P17677	238 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	STXBP2	Q15833	593 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ANKRD7	Q92527	254 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	IQCD	Q96DY2	449 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	DEFB118	Q96PH6	123 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	NACC1	Q96RE7	527 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	LXN	Q9BS40	222 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	POLD4	Q9HCU8	107 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	GNA14	O95837	355 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	CCND2	P30279	289 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	LY6K	Q17RY6	165 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	BANK1	Q8NDB2	785 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-231	ENST00000566279	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	NDUFA10	O95299	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	SMPD1	P17405	629 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGAP25	P42331	645 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	SP2	Q02086	613 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	ADAM9	Q13443	819 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	MTMR1	Q13613	665 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	IWS1	Q96ST2	819 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	SFI1	A8K8P3	1242 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	CETN3	O15182	167 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	FAM13A	O94988	1023 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	PGK1	P00558	417 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	NR2F2	P24468	414 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	CASQ1	P31415	396 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF131	P52739	623 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	SOX10	P56693	466 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	KCND2	Q9NZV8	630 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	WDR81	Q562E7	1941 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	MYADML2	A6NDP7	307 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-231	ENST00000566279	PDXK	O00764	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms