RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.22■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.22■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 DAW1Q8N136 415 aa21.22■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 METTL13Q8N6R0 699 aa21.22■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.22■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 DRC1Q96MC2 740 aa21.22■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 EXOC1Q9NV70 894 aa21.22■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 RMND1Q9NWS8 449 aa21.22■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.22■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.22■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.22■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 BIN1O00499 593 aa21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 HOXC8P31273 242 aa21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 ADAM17P78536 824 aa21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 HIC1Q14526 733 aa21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 ISM2Q6H9L7 571 aa21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 SESTD1Q86VW0 696 aa21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 KIFAP3Q92845 792 aa21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 TMEM143Q96AN5 459 aa21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 PARVGQ9HBI0 331 aa21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CTU2-204ENST00000564105 RHOBTB3O94955 611 aa21.2■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 GAP43P17677 238 aa21.2■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 ZNF131P52739 623 aa21.2■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 IER5Q5VY09 327 aa21.2■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.2■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 MYCT1Q8N699 235 aa21.2■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 TCP11Q8WWU5 503 aa21.2■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 TREHO43280 583 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 DNM2P50570 870 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 CLCN3P51790 818 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 DRP2Q13474 957 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 SFR1Q86XK3 245 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 CYP2C9P11712 490 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 TMOD1P28289 359 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 ARL2P36404 184 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 EHHADHQ08426 723 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 MORC3Q14149 939 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.19■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 ALPK3Q96L96 1907 aa21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 PLS3P13797 630 aa21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 RTP1P59025 263 aa21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 PSMD2Q13200 908 aa21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 ODR4Q5SWX8 454 aa21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 HPS3Q969F9 1004 aa21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 IFT74Q96LB3 600 aa21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.18■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 ARVCFO00192 962 aa21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 CAPN2P17655 700 aa21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 PEX3P56589 373 aa21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 NLRP12P59046 1061 aa21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 BSNDQ8WZ55 320 aa21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.17■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 BMP6P22004 513 aa21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 GLRA2P23416 452 aa21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 TYRO3Q06418 890 aa21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 MAP7D2Q96T17 732 aa21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 AKT3Q9Y243 479 aa21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 GDAQ9Y2T3 454 aa21.16■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 CCDC192P0DO97 292 aa21.15■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 STK4Q13043 487 aa21.15■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 PPP2R5AQ15172 486 aa21.15■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 PTGISQ16647 500 aa21.15■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.15■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.15■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CTU2-204ENST00000564105 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms