RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNE4	Q8N205	404 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	MLST8	Q9BVC4	326 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	CD244	Q9BZW8	370 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	FZD1	Q9UP38	647 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PPFIA4	O75335	1185 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGB1	P05556	798 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCY8	P40145	1251 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	RASGRF1	Q13972	1273 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SMC5	Q8IY18	1101 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF276	Q8N554	614 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	WNK4	Q96J92	1243 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	XDH	P47989	1333 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0G2JNJ9	132 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	ARVCF	O00192	962 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PDPK1	O15530	556 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GALT2	O43825	422 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	AMY2A	P04746	511 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	AMY2B	P19961	511 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	RABL3	Q5HYI8	236 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM209A	Q5JX71	171 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	MORC4	Q8TE76	937 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	RABGGTA	Q92696	567 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOC2	Q96KP1	924 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG1	Q9BT22	464 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	INCENP	Q9NQS7	918 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT8	Q9NY28	637 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957		Q9UFV3	132 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	COL4A3	Q01955	1670 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PRX2	142 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	MAN2B1	O00754	1011 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0355	O15063	1070 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM20B	O75063	409 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD16A	O95870	558 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGS1	P23219	599 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR19	Q15760	415 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	HTR3D	Q70Z44	454 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRN2	Q92932	1015 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	BTBD2	Q9BX70	525 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR87	Q9BY21	358 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	CBLC	Q9ULV8	474 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	AQP7	O14520	342 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM153B	P0C7A2	387 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AKAP13-223	ENST00000560957	PYGM	P11217	842 aa		3.78	□□□□□ -1.8

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