RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 EMC7Q9NPA0 242 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 TBK1Q9UHD2 729 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CDHR2Q9BYE9 1310 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 KDRP35968 1356 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 XYLBO75191 536 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CILPO75339 1184 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 FKBP9O95302 570 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC4A1P02730 911 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 GYS1P13807 737 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 PPM1AP35813 382 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 PIK3CBP42338 1070 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 MAGEA8P43361 318 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 IRAK1P51617 712 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 PDE1AP54750 535 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 GTF2H3Q13889 308 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 NWD1Q149M9 1564 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 INAVAQ3KP66 663 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 POTEAQ6S8J7 498 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 WNK4Q96J92 1243 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 PPM1MQ96MI6 270 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 TCF12Q99081 682 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 DISC1Q9NRI5 854 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 LTN1O94822 1766 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 FRMD3A2A2Y4 597 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 HMMRO75330 724 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 RASSF9O75901 435 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 FGFR4P22455 802 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 ARHGAP25P42331 645 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 TM4SF4P48230 202 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 SCNN1BP51168 640 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 HSD17B7P56937 341 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 GNG11P61952 73 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 NAA25Q14CX7 972 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 OR2C3Q8N628 320 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 SPATA5Q8NB90 893 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 DHX58Q96C10 678 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC9A7Q96T83 725 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 LRRC3Q9BY71 257 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 ABCG4Q9H172 646 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 KAT14Q9H8E8 782 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 BATF3Q9NR55 127 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 ANO10Q9NW15 660 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 ATP10DQ9P241 1426 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 KIAA0754O94854 1291 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 AKR1B1P15121 316 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 PEX2P28328 305 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 AMPHP49418 695 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 EVX2Q03828 476 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 SNX1Q13596 522 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CCNG2Q16589 344 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 KLHL3Q9UH77 587 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CUTAO60888 179 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 EOMESO95936 686 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 EPHX1P07099 455 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 CKMT1AP12532 417 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 TNFSF4P23510 183 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 SKOR1P84550 965 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TSPAN3-209ENST00000560715 PRKG2Q13237 762 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms