RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 HSF2BPO75031 334 aa24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 RAD17O75943 681 aa24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 SOX5P35711 763 aa24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 TNNC1P63316 161 aa24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 TRADDQ15628 312 aa24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 FAM160B2Q86V87 743 aa24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 BANK1Q8NDB2 785 aa24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 INTUQ9ULD6 942 aa24.62■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 OPA1O60313 960 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 TRIM49P0CI25 452 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 TRIM49CP0CI26 452 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 GUCY2CP25092 1073 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 MAPK7Q13164 816 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 DAW1Q8N136 415 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 STK33Q9BYT3 514 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 GPR88Q9GZN0 384 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 KCNA3P22001 575 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 TTLL6Q8N841 843 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 SCFD2Q8WU76 684 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 ZIM3Q96PE6 472 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 STRA6Q9BX79 667 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.61■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 CEP104O60308 925 aa24.6■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 HIP1RO75146 1068 aa24.6■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 PPP1R37O75864 691 aa24.6■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 PPFIA1Q13136 1202 aa24.6■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 TTMPQ5BVD1 217 aa24.6■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.6■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 METTL13Q8N6R0 699 aa24.6■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 ARL8AQ96BM9 186 aa24.6■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 FEM1BQ9UK73 627 aa24.6■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.6■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 DPEP1P16444 411 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 ITGB5P18084 799 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 MREGQ8N565 214 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 MXRA8Q9BRK3 442 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 SYT11Q9BT88 431 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 VEZTQ9HBM0 779 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 PSME4Q14997 1843 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 GALCP54803 685 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 PPP2R5AQ15172 486 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 PEX26Q7Z412 305 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 RUFY1Q96T51 708 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 RIT2Q99578 217 aa24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 GUCY2FP51841 1108 aa24.58■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 TGFB2P61812 414 aa24.58■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 IQCKQ8N0W5 287 aa24.58■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.58■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.58■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
RCCD1-208ENST00000557266 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 TBC1D12O60347 775 aa24.58■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 CLSTN1O94985 981 aa24.58■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 CAP2P40123 477 aa24.58■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 HSD17B4P51659 736 aa24.58■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 NPEPPSP55786 919 aa24.58■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.58■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.58■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.58■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 ERVK-9P63128 1117 aa24.57■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 MYL7Q01449 175 aa24.57■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.57■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 NT5DC3Q86UY8 548 aa24.57■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 OGFOD1Q8N543 542 aa24.57■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.522e-7■■■□□ 16.5
RCCD1-208ENST00000557266 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.57■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 COL20A1Q9P218 1284 aa24.57■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 APEX2Q9UBZ4 518 aa24.57■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 COL4A5P29400 1685 aa24.57■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.56■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 LMNB1P20700 586 aa24.56■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 PTGER2P43116 358 aa24.56■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 BFSP1Q12934 665 aa24.56■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 DAAM2Q86T65 1068 aa24.56■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 SRLQ86TD4 932 aa24.56■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 WHAMMQ8TF30 809 aa24.56■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.56■■□□□ 1.52
RCCD1-208ENST00000557266 PKD2L1Q9P0L9 805 aa24.56■■□□□ 1.52
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