RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557069.1

RALGAPA1-216, Transcript of Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 1, human

TSL 2

Gene RALGAPA1, Length 467 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	RAMP2	O60895	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	KCNA6	P17658	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	RGS3	P49796	1198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ANTXR2	P58335	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069		Q6ZRM9	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	NPTXR	O95502	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	SCNN1G	P51170	649 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	KIF11	P52732	1056 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ROM1	Q03395	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	RASA3	Q14644	834 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	DGKD	Q16760	1214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	KRT40	Q6A162	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	FOXB1	Q99853	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069		M0R2C6	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	FSTL1	Q12841	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	UBXN4	Q92575	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	DAPK3	O43293	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	FAM20B	O75063	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	TGM1	P22735	817 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	PRRX2	Q99811	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RALGAPA1-216	ENST00000557069	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	MFAP3L	O75121	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	PEX11B	O96011	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	PRL	P01236	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	SERINC3	Q13530	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	HAS1	Q92839	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	PIF1	Q9H611	641 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RALGAPA1-216	ENST00000557069	XDH	P47989	1333 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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