RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222		C9IYK1	514 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	LARGE1	O95461	756 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	IFNAR1	P17181	557 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	ITGB5	P18084	799 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SPECC1	Q5M775	1068 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	IER5	Q5VY09	327 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CES5A	Q6NT32	575 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		15.69	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CACNA1G	O43497	2377 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	KRBA1	A5PL33	1030 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	STK25	O00506	426 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CFH	P08603	1231 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	MYB	P10242	640 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	KRT76	Q01546	638 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	NECAB1	Q8N987	351 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CASP10	Q92851	521 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	GTF3C6	Q969F1	213 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CASD1	Q96PB1	797 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	DENND3	A2RUS2	1198 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	POTEM	A6NI47	508 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CPLX1	O14810	134 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	MCM2	P49736	904 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	PLCB3	Q01970	1234 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	TRAF1	Q13077	416 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	POTEG	Q6S5H5	508 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	PHKB	Q93100	1093 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	RGS18	Q9NS28	235 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	COL4A3	Q01955	1670 aa		15.67	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222		M0QZ92	97 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	LRRN2	O75325	713 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	RPS6KA5	O75582	802 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	EOMES	O95936	686 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	ST3GAL1	Q11201	340 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	KCNK12	Q9HB15	430 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CA14	Q9ULX7	337 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		15.66	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	MEIS2	O14770	477 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CDKL5	O76039	1030 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CTDNEP1	O95476	244 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CXCL14	O95715	111 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	LAG3	P18627	525 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	MTHFR	P42898	656 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	ITIH3	Q06033	890 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	FAM228A	Q86W67	206 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	RNF169	Q8NCN4	708 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	OSMR	Q99650	979 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	LZTS1	Q9Y250	596 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CEP250	Q9BV73	2442 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		15.65	■□□□□ 0.1
CS-231	ENST00000552222	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	KLRC1	P26715	233 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	TDG	Q13569	410 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	UBE2S	Q16763	222 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		15.64	■□□□□ 0.09
CS-231	ENST00000552222	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		15.64	■□□□□ 0.09

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