RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 F8W8V4 182 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 M0R2C6 588 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 KCNQ3O43525 872 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MSCO60682 206 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MYL3P08590 195 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FNTAP49354 379 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PHEXP78562 749 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 METTL13Q8N6R0 699 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 OTUD5Q96G74 571 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CARD9Q9H257 536 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RAD21L1Q9H4I0 556 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PFASO15067 1338 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 F8W810 466 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PTGS2P35354 604 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SLC7A5Q01650 507 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ERO1BQ86YB8 467 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NEK9Q8TD19 979 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GID8Q9NWU2 228 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GINS2Q9Y248 185 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MAP3K13O43283 966 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CAMTA2O94983 1202 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CHRNA5P30532 468 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CLCN6P51797 869 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GPSM2P81274 684 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 UBXN1Q04323 297 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 KCNB1Q14721 858 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 STX1AQ16623 288 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 LIN9Q5TKA1 542 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DPF2Q92785 391 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 A6NJR5 290 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 KLRF2D3W0D1 207 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GNA14O95837 355 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC166P0CW27 439 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SCARF1Q14162 830 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PDXDC1Q6P996 788 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 C7orf31Q8N865 590 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GGA3Q9NZ52 723 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SMCO2A6NFE2 343 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RARBP10826 455 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TRPC1P48995 793 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TNFAIP2Q03169 654 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ARMC3Q5W041 872 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ANO1Q5XXA6 986 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC138Q96M89 665 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 USP28Q96RU2 1077 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TEX28O15482 410 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RPS6KB1P23443 525 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 CHMLP26374 656 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 MXI1P50539 228 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SP3Q02447 781 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-210ENST00000551525 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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