RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-204ENST00000548823 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 H0Y858 1186 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 COASYQ13057 564 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 IQCB1Q15051 598 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 RMDN3Q96TC7 470 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 TLR9Q9NR96 1032 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 MCM7P33993 719 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 INF2Q27J81 1249 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 MCTP2Q6DN12 878 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 NEK8Q86SG6 692 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 TBC1D5Q92609 795 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 PLVAPQ9BX97 442 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 CLEC1BQ9P126 229 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 COL20A1Q9P218 1284 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM186AA6NE01 2351 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 HOXC8P31273 242 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 CAMK1Q14012 370 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 EFHBQ8N7U6 833 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 TRAF1Q13077 416 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 SPECC1Q5M775 1068 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 CUL5Q93034 780 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 TREHO43280 583 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 CSPG5O95196 566 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 CTSHP09668 335 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 SLFN14P0C7P3 912 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 ICAM3P32942 547 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 LUZP1Q86V48 1076 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 P2RX5Q93086 422 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 SPATA33Q96N06 139 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 TRPC6Q9Y210 931 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 PRR23AA6NEV1 266 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 ADCY5O95622 1261 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 NR3C2P08235 984 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 POSTNQ15063 836 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 USP49Q70CQ1 688 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 ABCB11O95342 1321 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-204ENST00000548823 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 NBL1P41271 181 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 IL17AQ16552 155 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SARM1Q6SZW1 724 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SPATA20Q8TB22 786 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 TBCKQ8TEA7 893 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 EPSTI1Q96J88 318 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 AK8Q96MA6 479 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 H3BRB1 525 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 TXLNAP40222 546 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 ID4P47928 161 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 PNOCQ13519 176 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM26DQ5JW98 314 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 IQUBQ8NA54 791 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 AMNQ9BXJ7 453 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-204ENST00000548823 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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