RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543823.1

SYTL1-208, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-208ENST00000543823 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 NEK9Q8TD19 979 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 GBP3Q9H0R5 595 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 ELP3Q9H9T3 547 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 IRF6O14896 467 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 PPP1R37O75864 691 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SASH3O75995 380 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 OAZ1P54368 228 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SULF1Q8IWU6 871 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 KCND2Q9NZV8 630 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 BTBD7Q9P203 1132 aa20.31■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 ATP2A1O14983 1001 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 PTK2Q05397 1052 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 TUBB2AQ13885 445 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 CBWD6Q4V339 395 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SPAG5Q96R06 1193 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 STRA6Q9BX79 667 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 CXCR5P32302 372 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SOX10P56693 466 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 CNTN2Q02246 1040 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 GBP6Q6ZN66 633 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.3■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 OTUD5Q96G74 571 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 ACAD9Q9H845 621 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 EHD2Q9NZN4 543 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 TACC1O75410 805 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 KCNA2P16389 499 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 IQCEQ6IPM2 695 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 COG1Q8WTW3 980 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 DMAC2Q9NW81 257 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.29■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.28■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 PJA2O43164 708 aa20.28■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 TBC1D8O95759 1140 aa20.28■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 DLG4P78352 724 aa20.28■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SLC18A3Q16572 532 aa20.28■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 TRIM58Q8NG06 486 aa20.28■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.28■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 UBE4BO95155 1302 aa20.28■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SLC16A4O15374 487 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 EXOC3O60645 756 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 LRRN2O75325 713 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 KLRC1P26715 233 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 CCND2P30279 289 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 FMO5P49326 533 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 VSNL1P62760 191 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SP2Q02086 613 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 XKR9Q5GH70 373 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 WDR64B1ANS9 1081 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 ZNF862O60290 1169 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 DNA2P51530 1060 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 PEX3P56589 373 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 LBX2Q6XYB7 198 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 ANO5Q75V66 913 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 CDCA5Q96FF9 252 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.27■□□□□ 0.84
SYTL1-208ENST00000543823 ARID2Q68CP9 1835 aa20.27■□□□□ 0.83
SYTL1-208ENST00000543823 ANO9A1A5B4 782 aa20.26■□□□□ 0.83
SYTL1-208ENST00000543823 PLS3P13797 630 aa20.26■□□□□ 0.83
SYTL1-208ENST00000543823 PLA2G4AP47712 749 aa20.26■□□□□ 0.83
SYTL1-208ENST00000543823 C2orf54Q08AI8 447 aa20.26■□□□□ 0.83
SYTL1-208ENST00000543823 NFIL3Q16649 462 aa20.26■□□□□ 0.83
SYTL1-208ENST00000543823 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.26■□□□□ 0.83
SYTL1-208ENST00000543823 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms