RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543644.1

FCHSD2-209, Transcript of FCH and double SH3 domains 2, human

TSL 3

Gene FCHSD2, Length 321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHSD2-209	ENST00000543644	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	PDCD1	Q15116	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	DGKD	Q16760	1214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FCHSD2-209	ENST00000543644	PRSS38	A1L453	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PRKD3	O94806	890 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PFKM	P08237	780 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	TBR1	Q16650	682 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PCDH8	O95206	1070 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	MRE11	P49959	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	EPHB4	P54760	987 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PPP2CB	P62714	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PPP2CA	P67775	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	NFIX	Q14938	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	AGBL4	Q5VU57	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PLAT	P00750	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CELA3B	P08861	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	MEOX1	P50221	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	NFYC	Q13952	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	SURF1	Q15526	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CT83	Q5H943	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PTPN18	Q99952	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644		K7ESF4	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	MATN2	O00339	956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	MAFG	O15525	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CTSW	P56202	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	ERVK-21	P61565	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	HGFAC	Q04756	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	FAP	Q12884	760 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	ADAM15	Q13444	863 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCHSD2-209	ENST00000543644	CFHR4	Q92496	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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