RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539994.5

GTF2H3-208, Transcript of general transcription factor IIH subunit 3, human

TSL 4

Gene GTF2H3, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTF2H3-208	ENST00000539994	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ADGRL2	O95490	1459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994		H0YGN5	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994		M0R2C6	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ABLIM1	O14639	778 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	GABRD	O14764	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	KIF3B	O15066	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ZEB2	O60315	1214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ZNF205	O95201	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	APP	P05067	770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	PYGM	P11217	842 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	SCNN1B	P51168	640 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	SLURP1	P55000	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	IL2	P60568	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	CYP4F8	P98187	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	MVK	Q03426	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	PLP2	Q04941	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	CDH19	Q9H159	772 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	CENPF	P49454	3210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ARVCF	O00192	962 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	CBX4	O00257	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	PRKD3	O94806	890 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	INSRR	P14616	1297 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	IFNGR1	P15260	489 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	NAT1	P18440	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	RHBDL3	P58872	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	GPR85	P60893	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	POU4F1	Q01851	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	DSG1	Q02413	1049 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	COPS5	Q92905	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	PXDN	Q92626	1479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	TNKS	O95271	1327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994		A0A1W2PQY0	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	AURKA	O14965	403 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	MSC	O60682	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	F2	P00734	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	GSN	P06396	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	ATF2	P15336	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	VAV1	P15498	845 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF2H3-208	ENST00000539994	BMP8B	P34820	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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