RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 HGSNATQ68CP4 663 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 KIAA1328Q86T90 577 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 VPS36Q86VN1 386 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 ERO1BQ86YB8 467 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 GOLGA1Q92805 767 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 GJA10Q969M2 543 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 ATG4CQ96DT6 458 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 GGA3Q9NZ52 723 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 CSADQ9Y600 493 aa8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 OTOFQ9HC10 1997 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 CCDC151A5D8V7 595 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 FANCGO15287 622 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 TACC1O75410 805 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 AKAP3O75969 853 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 CLSTN1O94985 981 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 MYBP10242 640 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 UCHL3P15374 230 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 KCNA2P16389 499 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 FERP16591 822 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 TCP1P17987 556 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 CASP5P51878 434 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 NPEPPSP55786 919 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 JAM2P57087 298 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 HERVK_113P62684 666 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 PPIL2Q13356 520 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 IRF5Q13568 498 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 BRD3Q15059 726 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 TCEAL1Q15170 157 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 STXBP2Q15833 593 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 XKR3Q5GH77 459 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 ODR4Q5SWX8 454 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 SULF1Q8IWU6 871 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 CPXCR1Q8N123 301 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 DAW1Q8N136 415 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 FBXL18Q96ME1 805 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 ALS2CR12Q96Q35 445 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 DESI2Q9BSY9 194 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 RAB21Q9UL25 225 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 NENFQ9UMX5 172 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 LCTP09848 1927 aa8.25□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.24□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 LRRC53A6NM62 1247 aa8.24□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.24□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 AKR1B10O60218 316 aa8.24□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 HIP1RO75146 1068 aa8.24□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 PIGRP01833 764 aa8.24□□□□□ -1.09
PACS1-211ENST00000531298 RSPH10BP0C881 870 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms