RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 CDC25AP30304 524 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 RABGGTBP53611 331 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF410Q86VK4 478 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM228AQ86W67 206 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 NLRP7Q8WX94 980 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM143Q96AN5 459 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 USP28Q96RU2 1077 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 MSRAQ9UJ68 235 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR182O15218 404 aa21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 F13A1P00488 732 aa21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 TIFAQ96CG3 184 aa21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 AK8Q96MA6 479 aa21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A087WZ62 844 aa21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 GJB5O95377 273 aa21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 PKP1Q13835 747 aa21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 HYIQ5T013 277 aa21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 KSR1Q8IVT5 923 aa21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 NLRP4Q96MN2 994 aa21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 TMX1Q9H3N1 280 aa21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 ENPP3O14638 875 aa21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 GRIN1Q05586 938 aa21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 COL4A6Q14031 1691 aa21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3-208ENST00000531226 ASAP2O43150 1006 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC26A4O43511 780 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 TLL1O43897 1013 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 MYOGP15173 224 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 PADI6Q6TGC4 694 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 Q7L0L9 218 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 TOP1MTQ969P6 601 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 PNMA5Q96PV4 448 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 E9PMD0 336 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 MGEA5O60502 916 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 EYA4O95677 639 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ARL2P36404 184 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 GRB10Q13322 594 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC39A14Q15043 492 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CABP7Q86V35 215 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 DEFB123Q8N688 67 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 DNM3Q9UQ16 869 aa21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SZT2Q5T011 3432 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CA3P07451 260 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP11B2P19099 503 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 UBA7P41226 1012 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 DSC3Q14574 896 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM119Q4V9L6 283 aa21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNK18Q7Z418 384 aa21.12■□□□□ 0.97
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