RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530978.1

RBM25-208, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 2

Gene RBM25, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-208	ENST00000530978	HIP1R	O75146	1068 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	DGAT1	O75907	488 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	RSPH10B	P0C881	870 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	GHR	P10912	638 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	FGFR4	P22455	802 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	TMOD1	P28289	359 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	GPC3	P51654	580 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	EPHB4	P54760	987 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	FPGS	Q05932	587 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	GPNMB	Q14956	572 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	E2F4	Q16254	413 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	TCTN1	Q2MV58	587 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	ADAL	Q6DHV7	355 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	MFSD5	Q6N075	450 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	RSPH3	Q86UC2	560 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	NLRP7	Q8WX94	980 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	BSND	Q8WZ55	320 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	SCLT1	Q96NL6	688 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978	OSMR	Q99650	979 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RBM25-208	ENST00000530978		A0A087WZ62	844 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	SFI1	A8K8P3	1242 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978		M0QZ92	97 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	SLC26A4	O43511	780 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	GPR32	O75388	356 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CYP11B2	P19099	503 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	GLRA2	P23416	452 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CMA1	P23946	247 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CASP1	P29466	404 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	DNM2	P50570	870 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	NDUFA8	P51970	172 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CAPS	Q13938	189 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	ARSH	Q5FYA8	562 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	FAM26D	Q5JW98	314 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	DYM	Q7RTS9	669 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	RPAIN	Q86UA6	219 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	DAW1	Q8N136	415 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	TMEM199	Q8N511	208 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	VWCE	Q96DN2	955 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	HPSE	Q9Y251	543 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	PPME1	Q9Y570	386 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978		A0A1W2PQ27	194 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978		A0A1W2PQ64	194 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978		A0A1W2PQD8	194 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	MYMK	A6NI61	221 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CAND2	O75155	1236 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CD52	P31358	61 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	ARL2	P36404	184 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	AFM	P43652	599 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	MAPK7	Q13164	816 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	LPIN1	Q14693	890 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	IER5	Q5VY09	327 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	NME8	Q8N427	588 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	RNF149	Q8NC42	400 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	TCP11	Q8WWU5	503 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	REEP2	Q9BRK0	252 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	MYH11	P35749	1972 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	LIG1	P18858	919 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	SYK	P43405	635 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8	3e-8	■■□□□ 11.8
RBM25-208	ENST00000530978	GIT2	Q14161	759 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	LONRF3	Q496Y0	759 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM25-208	ENST00000530978	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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