RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 PNMA2Q9UL42 364 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 RSPH10B2B2RC85 870 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 CLIC2O15247 247 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 TGFB1I1O43294 461 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 C21orf2O43822 256 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 RSPH10BP0C881 870 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 SHMT1P34896 483 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 DRG2P55039 364 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 AP3B2Q13367 1082 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 QRICH1Q2TAL8 776 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 Q4G0T1 1027 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 GLYCTKQ8IVS8 523 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 HVCN1Q96D96 273 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 PGM2Q96G03 612 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 STK33Q9BYT3 514 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 SERPINB13Q9UIV8 391 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 MEIS2O14770 477 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 PPIP5K2O43314 1243 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 SHBGP04278 402 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 MMP13P45452 471 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 ARHGAP4P98171 946 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 KCNA1Q09470 495 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 NEDD9Q14511 834 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 NFIL3Q16649 462 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 LENG9Q96B70 501 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 ADAM7Q9H2U9 754 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 BCAS3Q9H6U6 928 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 ERVK-5Q9HDB9 667 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 STK24Q9Y6E0 443 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 SPDYE3A6NKU9 549 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 GCNT3O95395 438 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 PMS2P54278 862 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 PRR16Q569H4 304 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 ZDHHC24Q6UX98 284 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 RUSC1Q9BVN2 902 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 GPR88Q9GZN0 384 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 OLFML3Q9NRN5 406 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 CCT8L1PA6NM43 557 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 ASAP2O43150 1006 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 MGRN1O60291 552 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 TRIM37O94972 964 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 CHN1P15882 459 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 CLUL1Q15846 466 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 JAMLQ86YT9 394 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 FAM186BQ8IYM0 893 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC197Q8NCU1 140 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 NEK9Q8TD19 979 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 ARHGEF26Q96DR7 871 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 DNAJC12Q9UKB3 198 aa12.47□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 FRMPD4Q14CM0 1322 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC169A6NNP5 214 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 VCAM1P19320 739 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 COPB2P35606 906 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 MAPK7Q13164 816 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 PIGWQ7Z7B1 504 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 CNBD1Q8NA66 436 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 GLG1Q92896 1179 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 FAM20AQ96MK3 541 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 BHMT2Q9H2M3 363 aa12.46□□□□□ -0.41
PTPRK-217ENST00000524534 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 EYA4O95677 639 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 MMEP08473 750 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 GAP43P17677 238 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 ABCB4P21439 1286 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 PTGIRP43119 386 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 FMO5P49326 533 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 PLTPP55058 493 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 ITIH4Q14624 930 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 SLC15A2Q16348 729 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 DENND2CQ68D51 928 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 ALG3Q92685 438 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 MKNK1Q9BUB5 465 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC134Q9H6E4 229 aa12.46□□□□□ -0.42
PTPRK-217ENST00000524534 POLLQ9UGP5 575 aa12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms