RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 SLC17A8Q8NDX2 589 aa28.61■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 C17orf80Q9BSJ5 609 aa28.61■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 RGS18Q9NS28 235 aa28.61■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 C1orf112Q9NSG2 853 aa28.61■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 CDH23Q9H251 3354 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 A0A087WZ62 844 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 DGKIO75912 1065 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 SARSP49591 514 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 GRB10Q13322 594 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF410Q86VK4 478 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 CRIPAKQ8N1N5 446 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 FIBCD1Q8N539 461 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 C4orf32Q8N8J7 132 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 PPM1EQ8WY54 764 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 ANKEF1Q9NU02 776 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 LRFN2Q9ULH4 789 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa28.6■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 ARID2Q68CP9 1835 aa28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 EMC2Q15006 297 aa28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 SLC24A5Q71RS6 500 aa28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 ERMNQ8TAM6 284 aa28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 GDPD5Q8WTR4 605 aa28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM143Q96AN5 459 aa28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 NLRP4Q96MN2 994 aa28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 SAMD11Q96NU1 681 aa28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 TUFT1Q9NNX1 390 aa28.59■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 GAS2O43903 313 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 FGFR4P22455 802 aa28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 PTGDRQ13258 359 aa28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 DSC3Q14574 896 aa28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 RILPL1Q5EBL4 403 aa28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 CATSPER3Q86XQ3 398 aa28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 KSR1Q8IVT5 923 aa28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 FBXO22Q8NEZ5 403 aa28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 PIGOQ8TEQ8 1089 aa28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa28.58■■■□□ 2.17
TCEA1-202ENST00000517351 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 C9IYK1 514 aa28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 LPXNO60711 386 aa28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 MED24O75448 989 aa28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 MICALL1Q8N3F8 863 aa28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 TCP11Q8WWU5 503 aa28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 MTRQ99707 1265 aa28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 MTCH2Q9Y6C9 303 aa28.57■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 A0A087WWV3 80 aa28.56■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 RARRES1P49788 294 aa28.56■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 EPC2Q52LR7 807 aa28.56■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM192Q8IY95 271 aa28.56■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 LAD1O00515 517 aa28.55■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 RPA1P27694 616 aa28.55■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa28.55■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.55■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 DGAT1O75907 488 aa28.54■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP28.54■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa28.54■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 HAUS3Q68CZ6 603 aa28.54■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa28.54■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 LRWD1Q9UFC0 647 aa28.54■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 NLRC5Q86WI3 1866 aa28.54■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 COL6A3P12111 3177 aa28.54■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 ASAP2O43150 1006 aa28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 GATMP50440 423 aa28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 FAM189BP81408 668 aa28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 POTEGQ6S5H5 508 aa28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 FERMT3Q86UX7 667 aa28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 NACC1Q96RE7 527 aa28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 RAB34Q9BZG1 259 aa28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 IFT122Q9HBG6 1241 aa28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM161AQ9NX61 479 aa28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa28.53■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
TCEA1-202ENST00000517351 CTNNB1P35222 781 aa28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms